RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa21.11■□□□□ 0.97
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CAPNS1-204ENST00000587718 SPINT2O43291 252 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-204ENST00000587718 SNCAP37840 140 aa21.11■□□□□ 0.97
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CAPNS1-204ENST00000587718 SH3BGRL3Q9H299 93 aa21.06■□□□□ 0.96
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZANQ9Y493 2812 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB29O14966 203 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-204ENST00000587718 YPEL1O60688 119 aa21.05■□□□□ 0.96
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