RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 C7orf66A4D0T2 115 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 G3V4G9 280 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 HSPA12AO43301 675 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 PF4P02776 101 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CD37P11049 281 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CD33P20138 364 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35B1P78383 322 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 EBI3Q14213 229 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TRIQKQ629K1 86 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF329Q86UD4 541 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 Q8N402 240 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 MED9Q9NWA0 146 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 RAB22AQ9UL26 194 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 NUDT19A8MXV4 375 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 LANCL1O43813 399 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TPPPO94811 219 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 DHFRP00374 187 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 RAB3BP20337 219 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ZBTB25P24278 435 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A1P30531 599 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CEACAM6P40199 344 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF137PP52743 207 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OR10A3P58181 314 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 HMGN3Q15651 99 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 LINC01559Q495D7 138 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TOR2AQ5JU69 321 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 C22orf42Q6IC83 251 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CNIH2Q6PI25 160 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 RAB3CQ96E17 227 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 S1PR3Q99500 378 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 PECRQ9BY49 303 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ABCG5Q9H222 651 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 HSF4Q9ULV5 492 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 HSPB11Q9Y547 144 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM30A4D0T7 59 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 LINC01548A6NM66 108 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 IFITM5A6NNB3 132 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 AP4M1O00189 453 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RAB29O14966 203 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 FABP7O15540 132 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 NAPSAO96009 420 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 IFNA7P01567 189 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 IGHG2P01859 326 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 SCTP09683 121 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 CD3GP09693 182 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 GPR12P47775 334 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 F2RL1P55085 397 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM50BP56557 158 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-DRB3P79483 266 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 MMDQ15546 238 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 STPG2Q8N412 459 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 Q8N9W7 124 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 GHITMQ9H3K2 345 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 Q9N2K0 584 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA1456Q9P272 454 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0B4J203 849 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 SHISA3A0PJX4 238 aa6.57□□□□□ -1.36
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