RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	SSR3	Q9UNL2	185 aa		7.32	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		7.32	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM30	A4D0T7	59 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	NOTO	A8MTQ0	251 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479		I3L521	148 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	MFNG	O00587	321 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV1-16	P04430	117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	OR8U8	P0C7N1	319 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	CD40LG	P29965	261 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	RUNX1	Q01196	453 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	CDNF	Q49AH0	187 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	OR5B12	Q96R08	314 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	GINS4	Q9BRT9	223 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	OR2D2	Q9H210	308 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		7.31	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	SOX15	O60248	233 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	SPDEF	O95238	335 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	DIRAS3	O95661	229 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	CA2	P00918	260 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	LGALS7	P47929	136 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	GNB1	P62873	340 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	NDP	Q00604	133 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF616	Q08AN1	781 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	CBX3	Q13185	183 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	FHL3	Q13643	280 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	FXYD3	Q14802	87 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	ACTBL2	Q562R1	376 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZS49	121 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	LFNG	Q8NES3	379 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		7.3	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC25A17	O43808	307 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	SCGN	O76038	276 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	CNIH1	O95406	144 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	CTXN2	P0C2S0	81 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	RRAS	P10301	218 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	DTYMK	P23919	212 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	ECI1	P42126	302 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	INSL3	P51460	131 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	PITPNA	Q00169	270 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	CD69	Q07108	199 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	HACD4	Q5VWC8	232 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF773	Q6PK81	442 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	BVES	Q8NE79	360 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	DCUN1D4	Q92564	292 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	ARPC1A	Q92747	370 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	MS4A10	Q96PG2	267 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	OR51E2	Q9H255	320 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01619	G3V211	115 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	OVOL1	O14753	267 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	SHOX	O15266	292 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV2-23	P01705	113 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	CRYGB	P07316	175 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	SDC2	P34741	201 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	TPPP2	P59282	170 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	MXD1	Q05195	221 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	RTL8B	Q17RB0	113 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM177	Q53S58	311 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	OR5T1	Q8NG75	326 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	RHOV	Q96L33	236 aa		7.28	□□□□□ -1.24
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM68	Q96MH6	324 aa		7.28	□□□□□ -1.24

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