RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 XRCC4Q13426 336 aa0.15□□□□□ -2.39
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FAM227B-211ENST00000560557 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
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FAM227B-211ENST00000560557 GOLGA8RI6L899 631 aa0.11□□□□□ -2.39
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