RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	S100A10	P60903	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ERVK-16	P61578	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF273	Q14593	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067		L7N2F9	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067		M0R1W7	72 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	NDUFS7	O75251	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	APOA2	P02652	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	RRAS	P10301	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	CEACAM3	P40198	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	H2BFS	P57053	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	LOXL3	P58215	753 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	VAMP2	P63027	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	CD300C	Q08708	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	PERP	Q96FX8	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067		A0A087X0M5	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067		A0A0D9SG52	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1B0GU03	582 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1B0GX30	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1W2PPE3	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067		H7C2Y5	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067		J3QR06	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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