RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ROBO3Q96MS0 1386 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 MED23Q9ULK4 1368 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 NALCNQ8IZF0 1738 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 BCL9O00512 1426 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 TRBV19A0A075B6N1 114 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 A0A0J9YXY3 114 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 C5orf63A6NC05 138 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 KRBOX1C9JBD0 128 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 H3BSA7 217 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 DEDDO75618 318 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 SERF1AO75920 110 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 APOMO95445 188 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 CDS2O95674 445 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ZNF682O95780 498 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ZNF806P0C7X5 589 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 PATE4P0C8F1 98 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 PSG2P11465 335 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 NPY1RP25929 384 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 GNB1P62873 340 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ELOCQ15369 112 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 CST6Q15828 149 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 GRK1Q15835 563 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 LCE1EQ5T753 118 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 RNF165Q6ZSG1 346 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 TMEM86AQ8N2M4 240 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 NUP35Q8NFH5 326 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 TSTD1Q8NFU3 115 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 C7orf33Q8WU49 177 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 PDXPQ96GD0 296 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ABHD14BQ96IU4 210 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ZNF382Q96SR6 550 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 MED28Q9H204 178 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 OR2D2Q9H210 308 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 GPR84Q9NQS5 396 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 GNG8Q9UK08 70 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 DNAJC12Q9UKB3 198 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 U3KQ87 197 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ATRNO75882 1429 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 TRAV4A0A0B4J268 109 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 TMEM72A0PK05 275 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 C9orf170A2RU37 121 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 M0R381 172 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 IGHV3-23P01764 117 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 IFNA4P05014 189 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 HLA-DQB2P05538 268 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 IGKV2-30P06310 120 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ADRA2AP08913 450 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 RPL7P18124 248 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP2.61□□□□□ -1.994e-7■■■■■ 32.6
CS-232ENST00000552331 CMPK1P30085 196 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ATP5G3P48201 142 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ZNF83P51522 516 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 WNT4P56705 351 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 MMDQ15546 238 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ZNF876PQ49A33 203 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 MORN2Q502X0 79 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 GUSBP11Q6P575 273 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 IL34Q6ZMJ4 242 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ZNF497Q6ZNH5 498 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 Q6ZS49 121 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 SLC30A7Q8NEW0 376 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 LMO3Q8TAP4 145 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 FAM104AQ969W3 186 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 PHYHIPLQ96FC7 376 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 PDCD10Q9BUL8 212 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 CXorf21Q9HAI6 301 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 POPDC3Q9HBV1 291 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 COA4Q9NYJ1 87 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 TVP23BQ9NYZ1 205 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 TAC3Q9UHF0 121 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 TBX21Q9UL17 535 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 TRIP11Q15643 1979 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 GON4LQ3T8J9 2241 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 VPS8Q8N3P4 1428 aa2.6□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 DOCK6Q96HP0 2047 aa2.6□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa2.6□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa2.6□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 NKX2-6A6NCS4 301 aa2.6□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 J3QRK9 145 aa2.6□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 SOCS3O14543 225 aa2.6□□□□□ -1.99
CS-232ENST00000552331 RGS5O15539 181 aa2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms