RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTPRB-208ENST00000550358 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 CD5P06127 495 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 PF4V1P10720 104 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 MPZP25189 248 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 PMCHL1Q16048 86 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM177Q53S58 311 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 OR51M1Q9H341 326 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 MARCH11A6NNE9 402 aa7.25□□□□□ -1.25
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