RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549519.5

IKZF4-208, Transcript of IKAROS family zinc finger 4, human

TSL 5

Gene IKZF4, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IKZF4-208	ENST00000549519	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		14	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	CFHR4	Q92496	578 aa		14	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		14	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		14	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	CLDN34	H7C241	214 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	TRIM77	I1YAP6	450 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	LYRM1	O43325	122 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	MOS	P00540	346 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	IGKV1D-33	P01593	117 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	IGKV1-33	P01594	117 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	IGLV2-14	P01704	120 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	DEFA1	P59665	94 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	DEFA3	P59666	94 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	EBI3	Q14213	229 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	LY6E	Q16553	131 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	RTL8B	Q17RB0	113 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	RNF5	Q99942	180 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	COPZ2	Q9P299	210 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	GPR132	Q9UNW8	380 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	TCF19	Q9Y242	345 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		13.99	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519		H0YJW9	148 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	PLA2G10	O15496	165 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	TNFSF12	O43508	249 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	VENTX	O95231	258 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	TMEM11	P17152	192 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	CD24	P25063	80 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	KIR2DS2	P43631	304 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	KCTD9	Q7L273	389 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	PDPN	Q86YL7	162 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	ZNF383	Q8NA42	475 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	C1RL	Q9NZP8	487 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.98	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519		A6NDX4	124 aa		13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	CRYBA1	P05813	215 aa		13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	HNF4G	Q14541	408 aa		13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	C11orf88	Q6PI97	169 aa		13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	C5orf30	Q96GV9	206 aa		13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	LINC00473	A8K010	186 aa		13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	FCGR3B	O75015	233 aa		13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	PIGP	P57054	158 aa		13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	LINC00205	P59089	165 aa		13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	RND3	P61587	244 aa		13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.96	□□□□□ -0.17
IKZF4-208	ENST00000549519	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519		M0QZK8	103 aa		13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	MPPED1	O15442	326 aa		13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	OR2F2	O95006	317 aa		13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	LGALS7	P47929	136 aa		13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	CCR6	P51684	374 aa		13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	ASAH1	Q13510	395 aa		13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	OR51H1	Q8NH63	302 aa		13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	DDB2	Q92466	427 aa		13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	CHIA	Q9BZP6	476 aa		13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	ESM1	Q9NQ30	184 aa		13.95	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	SHOX	O15266	292 aa		13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	NDUFB6	O95139	128 aa		13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	RLN1	P04808	185 aa		13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	PI3	P19957	117 aa		13.94	□□□□□ -0.18

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