RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542570.5

TOP3A-208, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOP3A, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 OR5B12Q96R08 314 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 TNCP24821 2201 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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TOP3A-208ENST00000542570 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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TOP3A-208ENST00000542570 TMEM230Q96A57 120 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 NRIP2Q9BQI9 281 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 UMAD1C9J7I0 102 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 J3QR06 171 aa8.52□□□□□ -1.05
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TOP3A-208ENST00000542570 RAB29O14966 203 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 LY6EQ16553 131 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 AANATQ16613 207 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 PRR27Q6MZM9 219 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 PLXNB1O43157 2135 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 CYB5BO43169 146 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 RAMP3O60896 148 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 POC1AQ8NBT0 407 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 BLNKQ8WV28 456 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 RAB40CQ96S21 281 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 HMSDA8MTL9 139 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 ATP6V0CP27449 155 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 S100A2P29034 98 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 SVBPQ8N300 66 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 NMES1Q9C002 83 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 HES4Q9HCC6 221 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 C19orf12Q9NSK7 152 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF292O60281 2723 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 MARCH11A6NNE9 402 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 LDLRAD4O15165 306 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 SPINK4O60575 86 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 GAMTQ14353 236 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 Q6ZR03 302 aa8.51□□□□□ -1.05
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TOP3A-208ENST00000542570 IL19Q9UHD0 177 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 MUC3AQ02505 3323 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF727A8MUV8 499 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 C10orf142B7Z368 130 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 PSMB3P49720 205 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM187Q14656 261 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 ECSCRQ19T08 205 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 DKK4Q9UBT3 224 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 B9A039 149 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 HIST1H3AP68431 136 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 CD177Q8N6Q3 437 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 RFNGQ9Y644 331 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 COX5AP20674 150 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 QRFPP83859 136 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 C4orf17Q53FE4 359 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 BTNL8Q6UX41 500 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 SAXO1Q8IYX7 474 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 C14orf79Q96F83 325 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00052Q96N35 136 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 NDUFS7O75251 213 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 RAB13P51153 203 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 GUK1Q16774 197 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 DYSFO75923 2080 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 H3BTX0 84 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 SNAPINO95295 136 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 S100PP25815 95 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-208ENST00000542570 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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