RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528847.1

RPS3-211, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS3, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-211ENST00000528847 LCE2BO14633 110 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 GLAP06280 429 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 CD2P06729 351 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 MGMTP16455 207 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 FASP25445 335 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 PPP3R1P63098 170 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 ATP5G2Q06055 141 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 Q96M66 194 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 POMPQ9Y244 141 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 LRRC42Q9Y546 428 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS3-211ENST00000528847 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 LGALS9O00182 355 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 XRCC3O43542 346 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 PDCD6O75340 191 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 OR9G9P0C7N8 305 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 CTRB1P17538 263 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 CEACAM6P40199 344 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 TNP2Q05952 138 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 FAM46BQ96A09 425 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 PHB2Q99623 299 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 AMBNQ9NP70 447 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 FBXL17Q9UF56 701 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 APLNQ9ULZ1 77 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 HERC1Q15751 4861 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 A0A1W2PPK0 400 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 TMEM213A2RRL7 107 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 ITGB1BP1O14713 200 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 GYS2P54840 703 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 APOC4P55056 127 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 AWAT2Q6E213 333 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 PDPNQ86YL7 162 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 SVOPQ8N4V2 548 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 THRSPQ92748 146 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 FAM223BA6NKX1 122 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 UBE2CO00762 179 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 RTL8CO15255 209 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 OR2J3O76001 311 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 IGHV3-23P01764 117 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 LIMS3P0CW19 117 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 LIMS4P0CW20 117 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 BTNL8Q6UX41 500 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 GPHB5Q86YW7 130 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 SETD6Q8TBK2 473 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 MED4Q9NPJ6 270 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 S4R3C0 116 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 ZNF320A2RRD8 509 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 IGLL5B9A064 214 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 M0R1X1 148 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 TUSC2O75896 110 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 S1PR2O95136 353 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 NAPSAO96009 420 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 APOA2P02652 100 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 IFNA4P05014 189 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 GABRB1P18505 474 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 CAPGP40121 348 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 TNXAQ16473 311 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 C15orf32Q32M92 178 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.43□□□□□ -1.22
RPS3-211ENST00000528847 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms