RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 K7EQM0 130 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 DCTN6O00399 190 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 CDC42EP2O14613 210 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 XRCC2O43543 280 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 SERPINA1P01009 418 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 IFNA14P01570 189 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 SEMG1P04279 462 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 TSPAN19P0C672 248 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF735P0CB33 412 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 IGHV1-8P0DP01 117 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 RRASP10301 218 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 FUT3P21217 361 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 HTR1DP28221 377 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 HSD11B1P28845 292 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 DDOSTP39656 456 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 CX3CR1P49238 355 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 GPM6AP51674 278 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 WNT4P56705 351 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 ACTR3P61158 418 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 ACTA2P62736 377 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 ACTG2P63267 376 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 ACTC1P68032 377 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 ACTA1P68133 377 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 FAM3AP98173 230 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 TATDN3Q17R31 274 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 CYBRD1Q53TN4 286 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 DRAM2Q6UX65 266 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 ACP7Q6ZNF0 438 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 SLC35E3Q7Z769 313 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 FUNDC1Q8IVP5 155 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 TPRX1Q8N7U7 411 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 PROKR2Q8NFJ6 384 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 OR11H1Q8NG94 326 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 OR10H4Q8NGA5 316 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 OR51L1Q8NGJ5 315 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 FAM81AQ8TBF8 368 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 SGK3Q96BR1 496 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 SLAMF6Q96DU3 332 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 PRRC1Q96M27 445 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 NMNAT3Q96T66 252 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 TMED9Q9BVK6 235 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 DNTTIP1Q9H147 329 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 EDA2RQ9HAV5 297 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 RETNQ9HD89 108 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 LGALS13Q9UHV8 139 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 TENM3Q9P273 2699 aa2.36□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 DNAH7Q8WXX0 4024 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 A0A087WUU8 490 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM210A6NLX4 147 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 LEUTXA8MZ59 168 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF878C9JN71 531 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 E9PLD3 99 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 TOR1AO14656 332 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 OVOL1O14753 267 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 SNNO75324 88 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 OR2F2O95006 317 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF682O95780 498 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 PGA5P0DJD9 388 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF728P0DKX0 622 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 RPA2P15927 270 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 NFYBP25208 207 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 PPT1P50897 306 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 DYNLT3P51808 116 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 PRRX1P54821 245 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 RPL8P62917 257 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 KIR2DS1Q14954 304 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 SNCBQ16143 134 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 KCTD21Q4G0X4 260 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 MINOS1Q5TGZ0 78 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 MEDAGQ5VYS4 303 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 PLCXD3Q63HM9 321 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 PVRIGQ6DKI7 326 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 LCN8Q6JVE9 175 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 SMARCD3Q6STE5 483 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 GDPD3Q7L5L3 318 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 FAM122BQ7Z309 247 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 DCXRQ7Z4W1 244 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 CYP4Z1Q86W10 505 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 SGPP2Q8IWX5 399 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 FTMTQ8N4E7 242 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF561Q8N587 486 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 COMMD1Q8N668 190 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 DRAM1Q8N682 238 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 CYB561A3Q8NBI2 242 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 OR11H6Q8NGC7 330 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 OR1N2Q8NGR9 330 aa2.35□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 OR8U1Q8NH10 309 aa2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms