RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520429.5

CCNC-210, Transcript of cyclin C, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNC, Length 2,473 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-210ENST00000520429 PKDREJQ9NTG1 2253 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 IFNL4K9M1U5 179 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 OR9G9P0C7N8 305 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 BMP5P22003 454 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 RAB2AP61019 212 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 TLE4Q04727 773 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 ZNF506Q5JVG8 444 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 LURAP1Q96LR2 239 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 TOLLIPQ9H0E2 274 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 RNF212BA8MTL3 300 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 ERVFRD-1P60508 538 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 TFF3Q07654 80 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 ADAM5Q6NVV9 412 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 ACSM6Q6P461 480 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 IGFL3Q6UXB1 125 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 MEGF10Q96KG7 1140 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 ZZEF1O43149 2961 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 MORN2Q502X0 79 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 ZNF429Q86V71 674 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 DEFB108BQ8NET1 73 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 COA4Q9NYJ1 87 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 MARCH11A6NNE9 402 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 FCGR3BO75015 233 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 LOXL3P58215 753 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 TIMM23BQ5SRD1 257 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 ZNF787Q6DD87 383 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 YPEL4Q96NS1 127 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 GNG12Q9UBI6 72 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-210ENST00000520429 CUL9Q8IWT3 2517 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 CRYAAP02489 173 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 RAB5AP20339 215 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 PTAFRP25105 342 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 CCKARP32238 428 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 HBG1P69891 147 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 HBG2P69892 147 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 DLK1P80370 383 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 C1orf185Q5T7R7 199 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 FAM90A1Q86YD7 464 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 ZBTB34Q8NCN2 500 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 DTD1Q8TEA8 209 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 ZNRD1Q9P1U0 126 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 SPINT2O43291 252 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 CLDN14O95500 239 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 MT-ND4LP03901 98 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 FOLR2P14207 255 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 RAB11AP62491 216 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 CATR1Q13166 79 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 FAM90A2PQ658T7 463 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 TACC2O95359 2948 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 DSCAML1Q8TD84 2053 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 LRBAP50851 2863 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 BTBD17A6NE02 478 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 OR2C1O95371 312 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 LHBP01229 141 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 PAX6P26367 422 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 RTP5Q14D33 572 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 RHEBQ15382 184 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 SLC25A22Q9H936 323 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 BIN3Q9NQY0 253 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 DCHS2Q6V1P9 2916 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 M0R1X1 148 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 AGAP20933 346 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 GLRXP35754 106 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 GPR12P47775 334 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 HTD2P86397 168 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 R3HDM4Q96D70 268 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 MUCL1Q96DR8 90 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 IFI27L2Q9H2X8 130 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 TUBA4BQ9H853 241 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 MMP23AO75900 390 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 CXCL1P09341 107 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-210ENST00000520429 C17orf58Q2M2W7 97 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms