RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 Q8N7P7 452 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM186Q96B77 213 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00473A8K010 186 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 FAM157AC9JC47 383 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 KIR2DS2P43631 304 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 LPAR6P43657 344 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 THBS3P49746 956 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 AKAP6Q13023 2319 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 ZFP69Q49AA0 526 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF585BQ52M93 769 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 NCR3LG1Q68D85 454 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 SPAG16Q8N0X2 631 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 PNKDQ8N490 385 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 SLC35G3Q8N808 338 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 BEND2Q8NDZ0 799 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 LHFPL5Q8TAF8 219 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 SEC22AQ96IW7 307 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 C2orf50Q96LR7 162 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 MMP26Q9NRE1 261 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 TENM4Q6N022 2769 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 ATG12O94817 140 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 TOX4O94842 621 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 IGLV1-47P01700 117 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 C1QBP02746 253 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 VDAC1P21796 283 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 COX7A1P24310 79 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF137PP52743 207 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 ID3Q02535 119 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 Q5PR19 223 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 NMES1Q9C002 83 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 SIRPDQ9H106 197 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 SIRT7Q9NRC8 400 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 MPTX1A8MV57 137 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 B4DSR2 109 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 RAMP3O60896 148 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 FCGR3BO75015 233 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 ARG1P05089 322 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 MSMBP08118 114 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 CT45A6P0DMU7 189 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 CT45A5P0DMU8 189 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 CT45A7P0DMV0 189 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 DLX1P56177 255 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00205P59089 165 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 PAX8Q06710 450 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 FGL1Q08830 312 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF383Q8NA42 475 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 DDB2Q92466 427 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 C1orf159Q96HA4 380 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 OR10C1Q96KK4 312 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 SPIN2AQ99865 258 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 COMMD9Q9P000 198 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 SPG11Q96JI7 2443 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 A0A096LNT2 108 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 SMLR1H3BR10 107 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 HPRT1P00492 218 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV1-39P01597 117 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV1D-39P04432 117 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-210ENST00000519815 RRASP10301 218 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms