RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516222.1

RNU6-561P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 561, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-561P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-561P-201ENST00000516222 K7EIL1 84 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 RFXANKO14593 260 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 UBDO15205 165 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 SIVA1O15304 175 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 CDK14O94921 469 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 PPBPP02775 128 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 FXYD7P58549 80 aa-0.91□□□□□ -2.56
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RNU6-561P-201ENST00000516222 ACTG1P63261 375 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 BTN3A2P78410 334 aa-0.91□□□□□ -2.56
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RNU6-561P-201ENST00000516222 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
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RNU6-561P-201ENST00000516222 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 NT5C3AQ9H0P0 336 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 MS4A12Q9NXJ0 267 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 MUC2Q02817 5179 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 MYO15BQ96JP2 1530 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 BICDL2A1A5D9 508 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 C10orf142B7Z368 130 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 TRAPPC2LH3BP13 241 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 M0R378 163 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 PMP2P02689 132 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 METTL15P1P0C7V9 234 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 DEFA4P12838 97 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 CCNOP22674 350 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 GADD45AP24522 165 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 IVDP26440 423 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
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RNU6-561P-201ENST00000516222 RPL28P46779 137 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR1E2P47887 323 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 PSMB3P49720 205 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 SULT1A2P50226 295 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 STX4Q12846 297 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 RESP18Q5W5W9 173 aa-0.92□□□□□ -2.56
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RNU6-561P-201ENST00000516222 MED28Q9H204 178 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 DCSTAMPQ9H295 470 aa-0.92□□□□□ -2.56
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RNU6-561P-201ENST00000516222 TMEM216Q9P0N5 145 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 U3KQA8 63 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 EML6Q6ZMW3 1958 aa-0.92□□□□□ -2.56
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RNU6-561P-201ENST00000516222 AKR7A2O43488 359 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 UGT2B10P36537 528 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 SPINT3P49223 89 aa-0.93□□□□□ -2.56
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RNU6-561P-201ENST00000516222 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 PSG9Q00887 426 aa-0.93□□□□□ -2.56
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RNU6-561P-201ENST00000516222 DOLPP1Q86YN1 238 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 TMEM156Q8N614 296 aa-0.93□□□□□ -2.56
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RNU6-561P-201ENST00000516222 OR13C9Q8NGT0 318 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR11L1Q8NGX0 322 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR5K1Q8NHB7 308 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 CDKL2Q92772 493 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 BEX2Q9BXY8 128 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 FBXL15Q9H469 300 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
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RNU6-561P-201ENST00000516222 EXTL2Q9UBQ6 330 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 NUP160Q12769 1436 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 ABCA12Q86UK0 2595 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 MTUS2Q5JR59 1369 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa-0.94□□□□□ -2.56
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RNU6-561P-201ENST00000516222 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
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RNU6-561P-201ENST00000516222 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 RAB4BP61018 213 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 TSPAN5P62079 268 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 LCN2P80188 198 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF345Q14585 488 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF846Q147U1 533 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 FAM27BQ5VT28 67 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-561P-201ENST00000516222 SPATA12Q7Z6I5 190 aa-0.94□□□□□ -2.56
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