RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 APOA2P02652 100 aa12.99□□□□□ -0.33
HERC3-211ENST00000513325 C2orf76Q3KRA6 126 aa12.99□□□□□ -0.33
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HERC3-211ENST00000513325 POC5Q8NA72 575 aa12.99□□□□□ -0.33
HERC3-211ENST00000513325 OR5T1Q8NG75 326 aa12.99□□□□□ -0.33
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HERC3-211ENST00000513325 ELOVL1Q9BW60 279 aa12.99□□□□□ -0.33
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HERC3-211ENST00000513325 CD3GP09693 182 aa12.98□□□□□ -0.33
HERC3-211ENST00000513325 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
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HERC3-211ENST00000513325 KCNK7Q9Y2U2 307 aa12.97□□□□□ -0.33
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HERC3-211ENST00000513325 C5orf30Q96GV9 206 aa12.95□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 HARBI1Q96MB7 349 aa12.95□□□□□ -0.34
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 A8MZ25 164 aa12.92□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 GNB3P16520 340 aa12.92□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 CRHBPP24387 322 aa12.92□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 SYNJ2BPP57105 145 aa12.92□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 OR10A3P58181 314 aa12.92□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa12.92□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 IL34Q6ZMJ4 242 aa12.92□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 PRSS48Q7RTY5 328 aa12.92□□□□□ -0.34
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