RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 LIN54Q6MZP7 749 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 PDPNQ86YL7 162 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 COMMD1Q8N668 190 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF152Q8N8N0 203 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 CLCC1Q96S66 551 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 TNCP24821 2201 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00473A8K010 186 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A17O43808 307 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 RBBP9O75884 186 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV2-23P01705 113 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 APOA2P02652 100 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMB8P28062 276 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 PPIFP30405 207 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 THBS3P49746 956 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 VBP1P61758 197 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF695Q8IW36 515 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 RAX2Q96IS3 184 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 KLK15Q9H2R5 256 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV41A0A0B4J266 112 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SOX15O60248 233 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 CA2P00918 260 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV2-14P01704 120 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 CX3CL1P78423 397 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 PITPNAQ00169 270 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 DDB2Q92466 427 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SNAPC3Q92966 411 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 GON7Q9BXV9 100 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFP57Q9NU63 452 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 ELANEP08246 267 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 CNIH2Q6PI25 160 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 BVESQ8NE79 360 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 HARBI1Q96MB7 349 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 P2RX4Q99571 388 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 GNB4Q9HAV0 340 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0A6YYH2 397 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 A6NJ64 397 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 SPDEFO95238 335 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV1-40P01703 118 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2B11Q5JQS5 317 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 BEST4Q8NFU0 473 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 GPHA2Q96T91 129 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PN81 502 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 HLA-DQB1P01920 261 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5H8P0DN80 308 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRNA7P36544 502 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 HOGA1Q86XE5 327 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF5Q99942 180 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 DIABLOQ9NR28 239 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 XRCC3O43542 346 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 TUSC2O75896 110 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 GABARAPO95166 117 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 CRYZL1O95825 349 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 CRYGBP07316 175 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R20P59543 309 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ARPC4P59998 168 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM177Q53S58 311 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ARPC1AQ92747 370 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms