RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496569.1

HDLBP-246, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-246ENST00000496569 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 GNB1P62873 340 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 DEFA5Q01523 94 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 KIR2DS1Q14954 304 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 IDNKQ5T6J7 187 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 GINS4Q9BRT9 223 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 TOLLIPQ9H0E2 274 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 SORL1Q92673 2214 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 APOA2P02652 100 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 HACD4Q5VWC8 232 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 TPRA1Q86W33 373 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 BVESQ8NE79 360 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 GON7Q9BXV9 100 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 COL7A1Q02388 2944 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 MEIS3P1A6NDR6 274 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00473A8K010 186 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 IGLV1-40P01703 118 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 IGLV2-23P01705 113 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 MC5RP33032 325 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 RANBP1P43487 201 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 SERPINB10P48595 397 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 GNG2P59768 71 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 PPP1R27Q86WC6 154 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 PDPNQ86YL7 162 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF491Q8N8L2 437 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 LFNGQ8NES3 379 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 MS4A10Q96PG2 267 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 GPHA2Q96T91 129 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 22.3
HDLBP-246ENST00000496569 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 I3L521 148 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 RBBP9O75884 186 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 IGHV3-11P01762 117 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 APELAP0DMC3 54 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 OR5H8P0DN80 308 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 DTYMKP23919 212 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 TMEM65Q6PI78 240 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 IDO2Q6ZQW0 420 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 REC114Q7Z4M0 266 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 OR11H1Q8NG94 326 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 ARPC1AQ92747 370 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 YIPF6Q96EC8 236 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 HARBI1Q96MB7 349 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF580Q9UK33 172 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 CRYZL1O95825 349 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 DUTP33316 252 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 RAB9AP51151 201 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 SLURP1P55000 103 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 FHL3Q13643 280 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 FXYD3Q14802 87 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 Q6ZS49 121 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 GHITMQ9H3K2 345 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 VSIG4Q9Y279 399 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-246ENST00000496569 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-246ENST00000496569 A0A087WW49 117 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-246ENST00000496569 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-246ENST00000496569 SHOXO15266 292 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-246ENST00000496569 AIREO43918 545 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-246ENST00000496569 SPDEFO95238 335 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-246ENST00000496569 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-246ENST00000496569 CRYGBP07316 175 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-246ENST00000496569 SLC6A1P30531 599 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-246ENST00000496569 ACTBL2Q562R1 376 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms