RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 F5H5K5 113 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 HSPB6O14558 160 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 NRASP01111 189 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 KRASP01116 189 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PRNPP04156 253 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR1D4P47884 311 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 HERV-K104P61576 105 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 Q0VG73 95 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 IGFLR1Q9H665 355 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 DEC1Q9P2X7 70 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 RNF212BA8MTL3 300 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 H0Y8X5 98 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV1-39P01597 117 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV1D-39P04432 117 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SRIP30626 198 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 DRD3P35462 400 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 C2orf27AQ580R0 203 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 STUMQ69YW2 141 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 DEFB125Q8N687 156 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR4A5Q8NH83 315 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 KCNS1Q96KK3 526 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PSENENQ9NZ42 101 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 FAM231BA6NCW3 169 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PSG2P11465 335 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TIMP3P35625 211 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 MYBPHQ13203 477 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TSTD1Q8NFU3 115 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR2M7Q8NG81 312 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CACNG5Q9UF02 275 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 DMDP11532 3685 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM131Q92545 1883 aa7.23□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PRR19A6NJB7 356 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 H0YJW9 148 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 H3BML4 177 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 NDUFS8O00217 210 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 VDAC1P21796 283 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CRYBA4P53673 196 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TFF2Q03403 129 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TNXAQ16473 311 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 LINC01565O15544 149 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 VENTXO95231 258 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 UQCRFS1P47985 274 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 LGALS4P56470 323 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 FXYD3Q14802 87 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 KIAA0895LQ68EN5 471 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 RDH5Q92781 318 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 GPR27Q9NS67 375 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ABI3Q9P2A4 366 aa7.22□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SLC22A20A6NK97 555 aa7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 BMPR1BO00238 502 aa7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 S1PR2O95136 353 aa7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 FBLP22087 321 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CD24P25063 80 aa7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 NPY1RP25929 384 aa7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 RAB9AP51151 201 aa7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SPINK9Q5DT21 86 aa7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 DGAT2Q96PD7 388 aa7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms