RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 MSGN1A6NI15 193 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 H0YIZ8 118 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC17A2O00624 439 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 LMX1BO60663 402 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 MAS1P04201 325 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 AKR1C4P17516 323 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PIGTQ969N2 578 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 SDSLQ96GA7 329 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 BSNQ9UPA5 3926 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 C16orf97H3BN30 126 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BSH0 61 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL21O00585 134 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CD3DP04234 171 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CLEC3BP05452 202 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF735P0CB33 412 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PSG1P11464 419 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 HLA-DRB3P79483 266 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF92Q03936 586 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM42Q69YG0 159 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM166AQ6J272 317 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 LYPD6Q86Y78 171 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CELA3BP08861 270 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CECR9P0C854 216 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PTHLHP12272 177 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PRSS3P35030 304 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB9AP51151 201 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 TDRG1Q3Y452 100 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5AS1Q8N127 324 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PR80 420 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PPIAL4DF5H284 164 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 AGFG2O95081 481 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 MT-CO2P00403 227 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL2P13500 99 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 TAS2R31P59538 309 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1CBP62140 327 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PAFAH1B2P68402 229 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 IL13RA1P78552 427 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1R1AQ13522 171 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB31Q13636 194 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PNKDQ8N490 385 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PTX4Q96A99 478 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 NAT8Q9UHE5 227 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GU03 582 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 H0YL77 283 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 GNG7O60262 68 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 NGFP01138 241 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 AMY2AP04746 511 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 GABRA2P47869 451 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM27E3Q08E93 113 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5B3Q8NH48 314 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB18Q9NP72 206 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.1□□□□□ -1.43
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