RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492897.3

HOXB-AS3-214, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PSG5Q15238 335 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RAB11BQ15907 218 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C2orf76Q3KRA6 126 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF260Q3ZCT1 412 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 AKIRIN2Q53H80 203 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF562Q6V9R5 426 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF383Q8NA42 475 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FAM3DQ96BQ1 224 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MGLLQ99685 303 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NDUFB11Q9NX14 153 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GAB2Q9UQC2 676 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 WASHC3Q9Y3C0 194 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SORL1Q92673 2214 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGKV1-16P04430 117 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ECI1P42126 302 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MAP2K4P45985 399 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 VEGFCP49767 419 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CLDN12P56749 244 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LINC00205P59089 165 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SPCS2Q15005 226 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SETD6Q8TBK2 473 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DCUN1D4Q92564 292 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SHISA3A0PJX4 238 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRDCB7Z8K6 153 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HSMCR30P0CW71 290 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CD40LGP29965 261 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SSX1Q16384 188 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF429Q86V71 674 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR56B1Q8NGI3 324 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR5B12Q96R08 314 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RNF150Q9ULK6 438 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 V9GY05 133 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-214ENST00000492897 A0A075B6Q4 140 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SPDEFO95238 335 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DIRAS3O95661 229 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CRYGBP07316 175 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ETV6P41212 452 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PSMD7P51665 324 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ECSCRQ19T08 205 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PYHIN1Q6K0P9 492 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RHOVQ96L33 236 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CABLES2Q9BTV7 478 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DCSTAMPQ9H295 470 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RDH8Q9NYR8 311 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RAB22AQ9UL26 194 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 A0A1W2PN81 502 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LINC01619G3V211 115 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RAB27BO00194 218 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OVOL1O14753 267 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGLV2-23P01705 113 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CHRNA7P36544 502 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MOGAT2Q3SYC2 334 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PDPNQ86YL7 162 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR4A4PQ8NGN8 299 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CASTOR1Q8WTX7 329 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 STUB1Q9UNE7 303 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 U3KQK5 164 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 A0A087WW49 117 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 H7C2Y5 167 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MFNGO00587 321 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HSPA12AO43301 675 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 BRI3O95415 125 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RANBP1P43487 201 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SLURP1P55000 103 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF45Q02386 682 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ACTBL2Q562R1 376 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ACSM6Q6P461 480 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LFNGQ8NES3 379 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C5orf30Q96GV9 206 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms