RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM91Q6ZNR0 172 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-210ENST00000489601 UFD1Q92890 307 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-210ENST00000489601 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM68Q96MH6 324 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-210ENST00000489601 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-210ENST00000489601 PECRQ9BY49 303 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-210ENST00000489601 SCN3BQ9NY72 215 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-210ENST00000489601 RDH8Q9NYR8 311 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-210ENST00000489601 STARD9Q9P2P6 4700 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A0G2JLM5 398 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 TRDCB7Z8K6 153 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 LDLRAD4O15165 306 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC25A17O43808 307 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 BRI3O95415 125 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 LGALS7P47929 136 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 TPBGQ13641 420 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAM1Q15629 374 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 LIPKQ5VXJ0 399 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 OR4A4PQ8NGN8 299 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 GRPEL2Q8TAA5 225 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM203Q969S6 136 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC35D1Q9NTN3 355 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 C19orf73Q9NVV2 129 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 M0R1X1 148 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 ARL6IP5O75915 188 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 CNIH1O95406 144 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 IGLV2-23P01705 113 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 CRYGBP07316 175 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 RANBP1P43487 201 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 SERPINB10P48595 397 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 RAB11BQ15907 218 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 HAPLN4Q86UW8 402 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 OR5T1Q8NG75 326 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 OR56B1Q8NGI3 324 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 VCXQ9H320 206 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 C2orf76Q3KRA6 126 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 PLAC9Q5JTB6 97 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 SGPP2Q8IWX5 399 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM3DQ96BQ1 224 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 RSRP1Q9BUV0 290 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 DIRAS3O95661 229 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 CLDN12P56749 244 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 RPS25P62851 125 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 PJVKQ0ZLH3 352 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM177Q53S58 311 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 IL34Q6ZMJ4 242 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 OR9G4Q8NGQ1 327 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 CABLES2Q9BTV7 478 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 DUSP21Q9H596 190 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 PALMDQ9NP74 551 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 SDHAF2Q9NX18 166 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 TPRKBQ9Y3C4 175 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 DNAH1Q9P2D7 4330 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 ANKRD34BA5PLL1 514 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 H0Y980 276 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 FABP7O15540 132 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 DENRO43583 198 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 HSMCR30P0CW71 290 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 AADACP22760 399 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 PSMD7P51665 324 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF343Q6P1L6 599 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 HARBI1Q96MB7 349 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 OR2D2Q9H210 308 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 EDA2RQ9HAV5 297 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 RAB22AQ9UL26 194 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 KCNK7Q9Y2U2 307 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 V9GY05 133 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 CD3GP09693 182 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 CALRP27797 417 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 CBX3Q13185 183 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 IGSF11Q5DX21 431 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 OR10J5Q8NHC4 309 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 RAB3CQ96E17 227 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 USMG5Q96IX5 58 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-210ENST00000489601 LCE6AA0A183 80 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 BET1O15155 118 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 SHOXO15266 292 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 FCGR3AP08637 254 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 GSTT2P0CG29 244 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 GSTT2BP0CG30 244 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 RRASP10301 218 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 SYNJ2BPP57105 145 aa12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms