RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM34P42696 430 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CCNG1P51959 295 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TAS2R31P59538 309 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL23P62829 140 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SKP1P63208 163 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MERTKQ12866 999 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SKP2Q13309 424 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SPANXN2Q5MJ10 180 aa1.74□□□□□ -2.13
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RABGGTB-211ENST00000489450 FAM201AQ5SY85 155 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 C10orf99Q6UWK7 81 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CROCCP2Q86T23 111 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MDP1Q86V88 176 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 LYPD1Q8N2G4 141 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 OR51F2Q8NH61 342 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 C17orf50Q8WW18 174 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD7Q92527 254 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CDS1Q92903 461 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR22Q99680 433 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 WFDC6Q9BQY6 131 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ULBP2Q9BZM5 246 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF442Q9H7R0 627 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ACOT9Q9Y305 439 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PQD3 144 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM159BA6NKW6 160 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 KRBOX1C9JBD0 128 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 FTCDNL1E5RQL4 147 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MANBAO00462 879 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 GABRPO00591 440 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP8B1O43520 1251 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CCNB2O95067 398 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV1-46P01743 117 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-HP01893 362 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TFF1P04155 84 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CD74P04233 296 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CD28P10747 220 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ELK4P28324 431 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 IL12BP29460 328 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 DEKP35659 375 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MAGEA12P43365 314 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB7AP51149 207 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 RAP1GDS1P52306 607 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 PRRX1P54821 245 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 AQP5P55064 265 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CCL8P80075 99 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CAV1Q03135 178 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 GLO1Q04760 184 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 C2orf54Q08AI8 447 aa1.73□□□□□ -2.13
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RABGGTB-211ENST00000489450 SPANXN3Q5MJ09 141 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 AP1ARQ63HQ0 302 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 HCP5Q6MZN7 132 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 C16orf87Q6PH81 154 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CASP12Q6UXS9 341 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TMPPEQ6ZT21 453 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM256Q8N2U0 113 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TBC1D19Q8N5T2 526 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO36Q8NEA4 188 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5D16Q8NGK9 328 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 APH1AQ96BI3 265 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC45Q96CN5 670 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC39Q96DD0 335 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 NRBF2Q96F24 287 aa1.73□□□□□ -2.13
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RABGGTB-211ENST00000489450 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 GGTLC1Q9BX51 225 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SAMD10Q9BYL1 202 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 C1orf198Q9H425 327 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 C16orf95Q9H693 158 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM27Q9HBJ8 222 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MED4Q9NPJ6 270 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 C8orf17Q9NRJ1 99 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 FAIMQ9NVQ4 179 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MS4A12Q9NXJ0 267 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SNX12Q9UMY4 172 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SAR1BQ9Y6B6 198 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 S4R3C0 116 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 DSCAML1Q8TD84 2053 aa1.72□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa1.72□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa1.72□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa1.72□□□□□ -2.13
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