RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	CTDSP2	O14595	271 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	PF4	P02776	101 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	PTHLH	P12272	177 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	CBX3	Q13185	183 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK10	Q15131	360 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2D2	Q9H210	308 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5H14	A6NHG9	310 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	RBBP9	O75884	186 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	IGF1	P05019	195 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ELANE	P08246	267 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5H8	P0DN80	308 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	RCVRN	P35243	200 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTB	P60709	375 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	LSAMP	Q13449	338 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424		H7C2Y5	167 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	APOA2	P02652	100 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	FCGR2C	P31995	323 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	MYCNOS	P40205	109 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXE3	Q13461	319 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	IL18	Q14116	193 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	LAX1	Q8IWV1	398 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	GPX8	Q8TED1	209 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	BORCS5	Q969J3	196 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424		M0R1X1	148 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	FCER2	P06734	321 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	NAT1	P18440	290 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	HERV-K104	P61576	105 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTBL2	Q562R1	376 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF5	Q99942	180 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	EHF	Q9NZC4	300 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PRX2	142 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	FABP12	A6NFH5	140 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424		J3QRK9	145 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	RRAS	P10301	218 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	THBS3	P49746	956 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN5	P62079	268 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF329	Q86UD4	541 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM17	Q86X19	198 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1456	Q9P272	454 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	DPPA5	A6NC42	116 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GABARAP	H6UMI1	98 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHG4	P01861	327 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DRB1	P01911	266 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PMP2	P02689	132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNA6	P05013	189 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CT45A6	P0DMU7	189 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CT45A5	P0DMU8	189 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CT45A7	P0DMV0	189 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DMA	P28067	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	RTL8B	Q17RB0	113 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	NPB	Q8NG41	125 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms