RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 CRYBA4P53673 196 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 CLDN17P56750 224 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 RAB38P57729 211 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 TPPP2P59282 170 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 RND3P61587 244 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 PAFAH1B2P68402 229 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 SRPXP78539 464 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 CCL20P78556 96 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 CCL7P80098 99 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 PDE7AQ13946 482 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 FZD2Q14332 565 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 MPV17LQ2QL34 196 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA45Q537H7 98 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM225Q6GV28 225 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 DPPA3Q6W0C5 159 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 COMMD6Q7Z4G1 85 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 HMGN2P46Q86SG4 172 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC35F2Q8IXU6 374 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 FGFRL1Q8N441 504 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 OR8G5Q8NG78 346 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 OR52L1Q8NGH7 329 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 OR5P2Q8WZ92 322 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 FGF13Q92913 245 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 NEURL3Q96EH8 262 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 OR10C1Q96KK4 312 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC35G5Q96KT7 338 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA33Q96N06 139 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 SMIM14Q96QK8 99 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 OR5B12Q96R08 314 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 OR2V2Q96R30 315 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 IMMP2LQ96T52 175 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGDIGQ99819 225 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 GABRG3Q99928 467 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 OCR1Q9BZK8 76 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 SGK2Q9HBY8 427 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM242Q9NWH2 141 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 TMED7Q9Y3B3 224 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC88CQ9P219 2028 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF840PA6NDX5 716 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 ARL5CA6NH57 179 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM166BA8MTA8 275 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 G3V4G9 280 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 H7BYZ3 331 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 HMGN4O00479 90 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 HYPMO75409 117 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 ETHE1O95571 254 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 SEMA4FO95754 770 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 EPPINO95925 133 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 MAS1P04201 325 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 PFN1P07737 140 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 OR4Q2P0C623 313 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 OR10J4P0C629 311 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 IGLC2P0DOY2 106 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 IGLC3P0DOY3 106 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 ESDP10768 282 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 IL9P15248 144 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 TCN2P20062 427 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 CTRLP40313 264 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 GABRA2P47869 451 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 P2RY1P47900 373 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC6A8P48029 635 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 CYB561P49447 251 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 PRLHRP49683 370 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 RAB9AP51151 201 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 FXYD6P3P58550 94 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 CKS1BP61024 79 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 GNB2P62879 340 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF92Q03936 586 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 MZT1Q08AG7 82 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 IL15RAQ13261 267 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC8B1Q6J4K2 584 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-210ENST00000485459 REG3GQ6UW15 175 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms