RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 YPEL1O60688 119 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 CD24P25063 80 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 GNG10P50151 68 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 GNMTQ14749 295 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 CDK10Q15131 360 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 MORN2Q502X0 79 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 LYSMD2Q8IV50 215 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 MFSD4AQ8N468 514 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 COMMD1Q8N668 190 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM229BQ8NBD8 167 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 OR9G1Q8NH87 305 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 CHPT1Q8WUD6 406 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 SNAPC3Q92966 411 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 YPEL2Q96QA6 119 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 SRRQ9GZT4 340 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 EHFQ9NZC4 300 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 OR1A1Q9P1Q5 309 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 PSG11Q9UQ72 335 aa9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 SORL1Q92673 2214 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 LANCL1O43813 399 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 DIRAS3O95661 229 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 IFNA6P05013 189 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 OR5H8P0DN80 308 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 HRH1P35367 487 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 RFX2P48378 723 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 THBS3P49746 956 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 PPP5CP53041 499 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 TAS2R19P59542 299 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 TSPAN5P62079 268 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 LSAMPQ13449 338 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 EBI3Q14213 229 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 ACTBL2Q562R1 376 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 UTF1Q5T230 341 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 TRIQKQ629K1 86 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 B9D2Q9BPU9 175 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 RDH8Q9NYR8 311 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 A0A1W2PPE3 182 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 PSMB11A5LHX3 300 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 J3QR06 171 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 J3QRK9 145 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 M0QYG6 137 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 RAB3DO95716 219 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 IGHG2P01859 326 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 CD3DP04234 171 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 AKAIN1P0CW23 69 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 TBPP20226 339 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 FCGR2CP31995 323 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 AP3S2P59780 193 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 BAK1Q16611 211 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 Q3ZCU0 254 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 CT45A1Q5HYN5 189 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 STEAP1BQ6NZ63 245 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 OR8H3Q8N146 312 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 OR6F1Q8NGZ6 308 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 CT45A3Q8NHU0 189 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 P2RX4Q99571 388 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 TSC22D3Q99576 134 aa9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 A0A1W2PPI3 338 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 SLC31A2O15432 143 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 GHRHP01286 108 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 OR8U9P0C7N5 309 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 CD40LGP29965 261 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 MYCNOSP40205 109 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 RAB7AP51149 207 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 DYRK1AQ13627 763 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 LY6G6FQ5SQ64 297 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM17Q86X19 198 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00311Q8N616 119 aa9.11□□□□□ -0.95
GARNL3-217ENST00000481875 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms