RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 MEIS3P1A6NDR6 274 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 HPGDSO60760 199 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 IGLV2-14P01704 120 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 ELK1P19419 428 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 DUTP33316 252 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 CFHR3Q02985 330 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 COMMD1Q8N668 190 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 ZNF645Q8N7E2 425 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 OR4F17Q8NGA8 305 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 DDB2Q92466 427 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 OR4F4Q96R69 305 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 GON7Q9BXV9 100 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 ANAPC10Q9UM13 185 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 LINC00473A8K010 186 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 FCN1O00602 326 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 RPL5P46777 297 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 THBS3P49746 956 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 SPCS2Q15005 226 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 BVESQ8NE79 360 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 IGLV2-23P01705 113 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 PRSS3P35030 304 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 MZT2AQ6P582 158 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 TEX38Q6PEX7 206 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 OR5AP2Q8NGF4 316 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 ADTRPQ96IZ2 230 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 NECAP2Q9NVZ3 263 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V0E1O15342 81 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A5O76082 557 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 SPDEFO95238 335 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 OR5H8P0DN80 308 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 NAT1P18440 290 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 VDAC1P21796 283 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 AADACP22760 399 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 FCGR2CP31995 323 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 CX3CL1P78423 397 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 NDPQ00604 133 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 PLGLAQ15195 96 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 TMEM177Q53S58 311 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 AP3S1Q92572 193 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 IFT46Q9NQC8 304 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 FBXO7Q9Y3I1 522 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 WSB1Q9Y6I7 421 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 PLXNB1O43157 2135 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 G3V318 75 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 IGHG4P01861 327 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 ELANEP08246 267 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 PPIFP30405 207 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 LGALS7P47929 136 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 TMBIM6P55061 237 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 C18orf65Q6ZTR6 163 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 RNF152Q8N8N0 203 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 GPX8Q8TED1 209 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 RAB2BQ8WUD1 216 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 CLCC1Q96S66 551 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 PARP11Q9NR21 331 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 ZFP57Q9NU63 452 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 PPYP01298 95 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 CRYGBP07316 175 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 RRASP10301 218 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 RPL30P62888 115 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 FOXE3Q13461 319 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 CDK10Q15131 360 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 LCNL1Q6ZST4 164 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 GIMAP1Q8WWP7 306 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 BCL7BQ9BQE9 202 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 FAM25AB3EWG3 89 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 FAM25CB3EWG5 89 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 FAM25GB3EWG6 89 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A17O43808 307 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 RTL8BQ17RB0 113 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 ZNF562Q6V9R5 426 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 OVCH2Q7RTZ1 564 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 SNX29P2Q8IUI4 249 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 LYSMD2Q8IV50 215 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 HARBI1Q96MB7 349 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 CCL28Q9NRJ3 127 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 TPSG1Q9NRR2 321 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-211ENST00000480301 TRAV41A0A0B4J266 112 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 CA2P00918 260 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 PF4V1P10720 104 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 PSMB8P28062 276 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 CBX3Q13185 183 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 C19orf54Q5BKX5 351 aa16.39■□□□□ 0.21
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