RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 VBP1P61758 197 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 NCS1P62166 190 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 RPS16P62249 146 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 ZNF329Q86UD4 541 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 RNF152Q8N8N0 203 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 ZNF383Q8NA42 475 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 BCL7BQ9BQE9 202 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 NOTCH1P46531 2555 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 TPPPO94811 219 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 PF4P02776 101 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 PRSS3P35030 304 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 ALDH3B2P48448 385 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 CTF1Q16619 201 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 ZNF562Q6V9R5 426 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 ZBTB34Q8NCN2 500 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 OR5AP2Q8NGF4 316 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 C15orf40Q8WUR7 153 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 HSPB9Q9BQS6 159 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 IFT46Q9NQC8 304 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 LINC01548A6NM66 108 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 TUSC2O75896 110 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1-16P04430 117 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 CNTFRP26992 372 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 CD40LGP29965 261 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 DUTP33316 252 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 TAS2R46P59540 309 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 PSG5Q15238 335 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 TMEM177Q53S58 311 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 GPR107Q5VW38 600 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 PYHIN1Q6K0P9 492 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 TMEM65Q6PI78 240 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 WFDC9Q8NEX5 89 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 RAB2BQ8WUD1 216 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 RITA1Q96K30 269 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 TMEM68Q96MH6 324 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 GPR61Q9BZJ8 451 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 SCPEP1Q9HB40 452 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 COMMD3Q9UBI1 195 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 LINC00527Q9UJ94 153 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 PLXNB1O43157 2135 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 TRAV41A0A0B4J266 112 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PRX2 142 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 SHOXO15266 292 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 CD33P20138 364 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 PSMB8P28062 276 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 RPL5P46777 297 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 TMBIM6P55061 237 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 TAS2R20P59543 309 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 CX3CL1P78423 397 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 CFHR3Q02985 330 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 VMA21Q3ZAQ7 101 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 AKIRIN2Q53H80 203 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 ZNF66Q6ZN08 573 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 OVCH2Q7RTZ1 564 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 ZNF695Q8IW36 515 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 GIMAP1Q8WWP7 306 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 HARBI1Q96MB7 349 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 AIFM2Q9BRQ8 373 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 FBXL15Q9H469 300 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 PARP11Q9NR21 331 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 NUDT19A8MXV4 375 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 SULT1C2O00338 296 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 ATP6V0E1O15342 81 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 NOL3O60936 208 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 PPIFP30405 207 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 FCGR2CP31995 323 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 MYCNOSP40205 109 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 KIR2DS2P43631 304 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 CDK10Q15131 360 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 C10orf99Q6UWK7 81 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 KCTD9Q7L273 389 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 GVQW1Q8N7I0 195 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 TEX45Q8NA69 505 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 MINDY2Q8NBR6 621 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 OR5M8Q8NGP6 311 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 DDB2Q92466 427 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 UBE2E2Q96LR5 201 aa10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms