RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 VDAC1P21796 283 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 NFYBP25208 207 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 UCP1P25874 307 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 SSTR5P35346 364 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 LMO4P61968 165 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 AVPI1Q5T686 147 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 Q6ZPA2 131 aa5.75□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM222Q9H0R3 208 aa5.75□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.75□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 TRAV20A0A0B4J274 112 aa5.74□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 A0A1B0GVG6 124 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 C5orf51A6NDU8 294 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 A6NJY4 79 aa5.74□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 LEUTXA8MZ59 168 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 J3QLI3 93 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 HSD17B6O14756 317 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 TCF21O43680 179 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 HRASP01112 189 aa5.74□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 PET100P0DJ07 73 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 RAB13P51153 203 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF137PP52743 207 aa5.74□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 TMEM187Q14656 261 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 FCN2Q15485 313 aa5.74□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 C12orf54Q6X4T0 127 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 DRAM1Q8N682 238 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.74□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 C2orf50Q96LR7 162 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 SEC22CQ9BRL7 303 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 PDCD10Q9BUL8 212 aa5.74□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 FXYD6Q9H0Q3 95 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 OR2D2Q9H210 308 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 C19orf12Q9NSK7 152 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 SDHAF2Q9NX18 166 aa5.74□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 PSG11Q9UQ72 335 aa5.74□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.73□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5.73□□□□□ -1.49
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SHQ1-207ENST00000475558 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 APOA2P02652 100 aa5.73□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 C1QBP02746 253 aa5.73□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 OR5AC1P0C628 307 aa5.73□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.73□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 SELLP14151 372 aa5.73□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 DUTP33316 252 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 LGALS7P47929 136 aa5.73□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 LGALS4P56470 323 aa5.73□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 PAX8Q06710 450 aa5.73□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 BAMBIQ13145 260 aa5.73□□□□□ -1.49
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF273Q14593 569 aa5.73□□□□□ -1.49
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