RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 MAFIPQ8WZ33 124 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TMEM203Q969S6 136 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 Q9N2K0 584 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 COA4Q9NYJ1 87 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 RDH8Q9NYR8 311 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 GHRLQ9UBU3 117 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 ZNF221Q9UK13 617 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 A8MZ25 164 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 CRYGBP07316 175 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 ZBTB25P24278 435 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 IGSF11Q5DX21 431 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TTC23Q5W5X9 447 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 DEFB125Q8N687 156 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 BVESQ8NE79 360 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 MSGN1A6NI15 193 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 BET1O15155 118 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 BRI3O95415 125 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 APOA2P02652 100 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 CD1AP06126 327 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 CD7P09564 240 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 SRMP19623 302 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 ZNF343Q6P1L6 599 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 PDPNQ86YL7 162 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 SETD9Q8NE22 299 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 HARBI1Q96MB7 349 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 RNF5Q99942 180 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 PECRQ9BY49 303 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 OR2D2Q9H210 308 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TRDCB7Z8K6 153 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 PTGES3LE9PB15 166 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 H0Y980 276 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 J3QRK9 145 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 BMPR1BO00238 502 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 ITGB1BP1O14713 200 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 SPDEFO95238 335 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 BPNT1O95861 308 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 UCHL1P09936 223 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 CD81P60033 236 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 ZNF45Q02386 682 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 RPEL1Q2QD12 228 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 MOGAT2Q3SYC2 334 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 PHYHIPQ92561 330 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 PTX4Q96A99 478 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 PHB2Q99623 299 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 A0A0G2JLM5 398 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 ZNF785A8K8V0 405 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 PPP5D1E7EU14 171 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-23P01764 117 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 IFNA6P05013 189 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 GSTT2P0CG29 244 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 GSTT2BP0CG30 244 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 CD37P11049 281 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 RHOGP84095 191 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 RCN1Q15293 331 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 RAB11BQ15907 218 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TNXAQ16473 311 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 LCN12Q6JVE5 192 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms