RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 GPHA2Q96T91 129 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 RASL11BQ9BPW5 248 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2D2Q9H210 308 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 MGAT4AQ9UM21 535 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 M0R1X1 148 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 RRHO14718 337 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V0E1O15342 81 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 NBR2O15453 112 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 SOX15O60248 233 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-DQB1P01920 261 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 CRYGBP07316 175 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 TALDO1P37837 337 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 PJVKQ0ZLH3 352 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 PSG5Q15238 335 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR107Q5VW38 600 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10J5Q8NHC4 309 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 DDB2Q92466 427 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 SNAPC3Q92966 411 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 PHF21AQ96BD5 680 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 CLCC1Q96S66 551 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 KLK15Q9H2R5 256 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 AUNIPQ9H7T9 357 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ETV7Q9Y603 341 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5H14A6NHG9 310 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 H7C2Y5 167 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 AP4M1O00189 453 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 XRCC3O43542 346 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 HPGDSO60760 199 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 TUSC2O75896 110 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-DRB1P01911 266 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 IGF1P05019 195 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLL1P15814 213 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 DUTP33316 252 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 SOX6P35712 828 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 RANBP1P43487 201 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 SCAND1P57086 179 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS2R20P59543 309 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 GNG2P59768 71 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 CX3CL1P78423 397 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR2DS1Q14954 304 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 CNIH2Q6PI25 160 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 HOGA1Q86XE5 327 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 BVESQ8NE79 360 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 OR8H1Q8NGG4 311 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 GINS4Q9BRT9 223 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 OR51J1Q9H342 316 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 COMMD3Q9UBI1 195 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF221Q9UK13 617 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ANAPC10Q9UM13 185 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 J3KRW8 73 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A17O43808 307 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 GABARAPO95166 117 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 DIRAS3O95661 229 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CA2P00918 260 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHG4P01861 327 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ELK1P19419 428 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 AADACP22760 399 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMB8P28062 276 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 THBS3P49746 956 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SPCS2Q15005 226 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB136Q30KP8 78 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 LIN54Q6MZP7 749 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXRED2Q8IWF2 684 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SAMD12Q8N8I0 201 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF152Q8N8N0 203 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 BEST4Q8NFU0 473 aa5.46□□□□□ -1.54
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