RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC6A7Q99884 636 aa6.71□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.71□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRRC42Q9Y546 428 aa6.71□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF737O75373 536 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SC5DO75845 299 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2H2O95918 312 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALDOBP05062 364 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV2-30P06310 120 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UCHL1P09936 223 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF44P15621 663 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCL3L1P16619 93 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EDDM3BP56851 147 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRK1Q15835 563 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6P435 159 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LHX4Q969G2 390 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPA2Q9H2U2 334 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BANF2Q9H503 90 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL6A5A8TX70 2615 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNHD1Q96M86 4753 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 J3QLI3 93 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 K7N7A8 449 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEGS1O15121 323 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPX5O75715 221 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SRMP19623 302 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAX6P26367 422 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLDN12P56749 244 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR10A3P58181 314 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AESQ08117 197 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C22orf42Q6IC83 251 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCF23Q7RTU1 214 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LYPD6Q86Y78 171 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8IYB0 196 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF561Q8N587 486 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8N7P7 452 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM104Q8NE00 496 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PXT1Q8NFP0 134 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NANPQ8TBE9 248 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 METTL9Q9H1A3 318 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR51E2Q9H255 320 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLK11Q9UBX7 282 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM172BPA6NC97 362 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCRL2O00421 344 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BUB3O43684 328 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX7A1P24310 79 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GADD45AP24522 165 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TGFBR1P36897 503 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPT1P50897 306 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAX9P55771 341 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAV3P56539 151 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIPPLY3P57055 190 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF146Q15072 292 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAF9Q16594 264 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HES5Q5TA89 166 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASCL4Q6XD76 172 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDH26Q8IXH8 852 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UPRTQ96BW1 309 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COQ2Q96H96 371 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 S100A13Q99584 98 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms