RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443667.1

PDZK1-204, Transcript of PDZ domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZK1, Length 1,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1-204ENST00000443667 RNF5Q99942 180 aa6.37□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 RNF126Q9BV68 326 aa6.37□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 ALG8Q9BVK2 526 aa6.37□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 CSTL1Q9H114 145 aa6.37□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.37□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 AGRNO00468 2067 aa6.37□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 UBE2QL1A1L167 161 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 FAM223BA6NKX1 122 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 RAB29O14966 203 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 SPDEFO95238 335 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 CST1P01037 141 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 AMBPP02760 352 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 T-ENOLP0DO92 83 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 EPHA2P29317 976 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 CRISP1P54107 249 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 GK3PQ14409 553 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 C15orf32Q32M92 178 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 RAB12Q6IQ22 244 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 GPHB5Q86YW7 130 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 TMEM68Q96MH6 324 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 METTL9Q9H1A3 318 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.36□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 NACAE9PAV3 2078 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 A8MWP6 167 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 MPPED1O15442 326 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 CCDC22O60826 627 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 IGLV2-23P01705 113 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 CRYGBP07316 175 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 HTR1AP08908 422 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 SCTP09683 121 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 RAB3AP20336 220 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 ARL3P36405 182 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 HTD2P86397 168 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 MED21Q13503 144 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 GAPTQ8N292 157 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 ZNF383Q8NA42 475 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 Q8NAQ8 132 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 TMEM163Q8TC26 289 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 PELI1Q96FA3 418 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 NSL1Q96IY1 281 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 Q96M66 194 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.35□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 GNGT2O14610 69 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 PROP1O75360 226 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 ATP6V1E1P36543 226 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 SOX2P48431 317 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 EFNB1P98172 346 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 TNXAQ16473 311 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 GID4Q8IVV7 300 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 NECAP1Q8NC96 275 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 GALMQ96C23 342 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 HRH4Q9H3N8 390 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 IL36GQ9NZH8 169 aa6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDZK1-204ENST00000443667 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 BAG2O95816 211 aa6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 IFNA21P01568 189 aa6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 IFNA17P01571 189 aa6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 C8orf88P0DMB2 117 aa6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ANXA8P13928 327 aa6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 TMEM187Q14656 261 aa6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 OR4A47Q6IF82 309 aa6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 PDPNQ86YL7 162 aa6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 S100A13Q99584 98 aa6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms