RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 RNF114Q9Y508 228 aa14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 CD3DP04234 171 aa14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 IFNA6P05013 189 aa14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 TAS2R19P59542 299 aa14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 C11orf88Q6PI97 169 aa14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 TMEM17Q86X19 198 aa14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 Q8N2B8 174 aa14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 M0QYG6 137 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 AMY1AP04745 511 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 AMY2AP04746 511 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 CSF1P09603 554 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 F2RL1P55085 397 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 CBX3Q13185 183 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 MMDQ15546 238 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 MSMO1Q15800 293 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 PYDC2Q56P42 97 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 PDPNQ86YL7 162 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 C3orf56Q8N813 242 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 BORCS5Q969J3 196 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 MOB3AQ96BX8 217 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 V9GYH0 126 aa14.54□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 RAB3DO95716 219 aa14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 IGLV2-14P01704 120 aa14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 RRASP10301 218 aa14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 ETV6P41212 452 aa14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 RTL8BQ17RB0 113 aa14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 Q6ZS46 218 aa14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 Q8N9W7 124 aa14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 RITA1Q96K30 269 aa14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 RNF5Q99942 180 aa14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 KIAA1456Q9P272 454 aa14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.53□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 LINC00473A8K010 186 aa14.52□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 HAX1O00165 279 aa14.52□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 NBR2O15453 112 aa14.52□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 CD74P04233 296 aa14.52□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 ZNF66Q6ZN08 573 aa14.52□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 KCTD9Q7L273 389 aa14.52□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 BVESQ8NE79 360 aa14.52□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 IGKV1-16P04430 117 aa14.51□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 CNTFRP26992 372 aa14.51□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 PROK1P58294 105 aa14.51□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 MEF2DQ14814 521 aa14.51□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.51□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.51□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.51□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 Q8N402 240 aa14.51□□□□□ -0.09
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PTX4-202ENST00000440447 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.51□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.51□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 NPBQ8NG41 125 aa14.51□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.51□□□□□ -0.09
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PTX4-202ENST00000440447 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.5□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 TNFSF12O43508 249 aa14.5□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 PEX14O75381 377 aa14.5□□□□□ -0.09
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PTX4-202ENST00000440447 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 ZNF79Q15937 498 aa14.5□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 ZNF747Q9BV97 191 aa14.5□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.5□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 DISC1C4P0D8 188 aa14.49□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 RRHO14718 337 aa14.49□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 FCGR3BO75015 233 aa14.49□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 NDUFA3O95167 84 aa14.49□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 LGALS7P47929 136 aa14.49□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 UCP3P55916 312 aa14.49□□□□□ -0.09
PTX4-202ENST00000440447 CATR1Q13166 79 aa14.49□□□□□ -0.09
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