RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 LGALS7P47929 136 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 ZNF383Q8NA42 475 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 ARPC1AQ92747 370 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 SLC35D1Q9NTN3 355 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 BET1O15155 118 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 PROP1O75360 226 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 CNIH1O95406 144 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 IGKV1-16P04430 117 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 TPPP2P59282 170 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 FXYD3Q14802 87 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 ARL6IP1Q15041 203 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 IZUMO2Q6UXV1 221 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 OR10R2Q8NGX6 335 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 CASTOR1Q8WTX7 329 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 CNBD2Q96M20 576 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 MS4A10Q96PG2 267 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 TENM3Q9P273 2699 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 GAB2Q9UQC2 676 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 IFITM5A6NNB3 132 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 H3BUA1 57 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 SLC25A17O43808 307 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 TRGV3P03979 118 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 FCGR3AP08637 254 aa11.72□□□□□ -0.53
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HERC3-206ENST00000431413 RAB6AP20340 208 aa11.72□□□□□ -0.53
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HERC3-206ENST00000431413 SLURP1P55000 103 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 PITPNAQ00169 270 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 GRPEL2Q8TAA5 225 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 TMEM68Q96MH6 324 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 OR4C12Q96R67 309 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 GINS4Q9BRT9 223 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 CABLES2Q9BTV7 478 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 OR2D2Q9H210 308 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 A0A075B6Q4 140 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 A0A087WW49 117 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 A0A0G2JLM5 398 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 IGHV3-11P01762 117 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 RRASP10301 218 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 RAB3BP20337 219 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 GALP22466 123 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 ARFRP1Q13795 201 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 RTL8BQ17RB0 113 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 IGSF11Q5DX21 431 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 ACSM6Q6P461 480 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 POC5Q8NA72 575 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 TPSG1Q9NRR2 321 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 NDUFB11Q9NX14 153 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 KCNK7Q9Y2U2 307 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-206ENST00000431413 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 RAB27BO00194 218 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 GSTT2P0CG29 244 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 GSTT2BP0CG30 244 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 GNB3P16520 340 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 OR10A3P58181 314 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 LINC00205P59089 165 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 SSX1Q16384 188 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
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HERC3-206ENST00000431413 RHOVQ96L33 236 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 HARBI1Q96MB7 349 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 ASCL2Q99929 193 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 SDHAF2Q9NX18 166 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 RAB26Q9ULW5 256 aa11.7□□□□□ -0.54
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HERC3-206ENST00000431413 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
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HERC3-206ENST00000431413 PLA2G7Q13093 441 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 ADTRPQ96IZ2 230 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 GP9P14770 177 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 SPNP16150 400 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 GABARAPL2P60520 117 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 VMA21Q3ZAQ7 101 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 TMEM177Q53S58 311 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 BVESQ8NE79 360 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 OR5T1Q8NG75 326 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 ATG5Q9H1Y0 275 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 STUB1Q9UNE7 303 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 SORL1Q92673 2214 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 IGLV2-23P01705 113 aa11.67□□□□□ -0.54
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