RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-208ENST00000420964 ADTRPQ96IZ2 230 aa10.01□□□□□ -0.81
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FAAP20-208ENST00000420964 TMEM222Q9H0R3 208 aa10.01□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 C7orf69Q9H7B7 122 aa10.01□□□□□ -0.81
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FAAP20-208ENST00000420964 A0A1W2PRD5 423 aa10□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 A0A1W2PRF3 423 aa10□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 A0A1W2PRM7 423 aa10□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 J3QLI3 93 aa10□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
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FAAP20-208ENST00000420964 UCP1P25874 307 aa10□□□□□ -0.81
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FAAP20-208ENST00000420964 REG1BP48304 166 aa10□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 UBE2E1P51965 193 aa10□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 LINC00205P59089 165 aa10□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa10□□□□□ -0.81
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FAAP20-208ENST00000420964 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.99□□□□□ -0.81
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FAAP20-208ENST00000420964 CT45A6P0DMU7 189 aa9.99□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 CT45A5P0DMU8 189 aa9.99□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 CT45A7P0DMV0 189 aa9.99□□□□□ -0.81
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FAAP20-208ENST00000420964 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.99□□□□□ -0.81
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FAAP20-208ENST00000420964 IGHV1-69P01742 117 aa9.98□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 APOA2P02652 100 aa9.98□□□□□ -0.81
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FAAP20-208ENST00000420964 ZNF585BQ52M93 769 aa9.98□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.98□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.98□□□□□ -0.81
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FAAP20-208ENST00000420964 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.98□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.98□□□□□ -0.81
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FAAP20-208ENST00000420964 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.98□□□□□ -0.81
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FAAP20-208ENST00000420964 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.97□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa9.97□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa9.97□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 A0A1W2PPI3 338 aa9.97□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 H0YJW9 148 aa9.97□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 CCSO14618 274 aa9.97□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 S1PR2O95136 353 aa9.97□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 CDS2O95674 445 aa9.97□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 RPA2P15927 270 aa9.97□□□□□ -0.81
FAAP20-208ENST00000420964 CXCL3P19876 107 aa9.97□□□□□ -0.81
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