RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF345Q14585 488 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM187Q14656 261 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 PCSK4Q6UW60 755 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 GAPTQ8N292 157 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 SMIM8Q96KF7 97 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 OR2V2Q96R30 315 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 POLEQ07864 2286 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 PPP1R2P9O14990 202 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 OR2F2O95006 317 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 LMO1P25800 156 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ERVFC1-1P60608 527 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 OR2F1Q13607 317 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 DCUN1D4Q92564 292 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 TUBA4BQ9H853 241 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 NAGKQ9UJ70 344 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 CACNA1DQ01668 2161 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 HSD17B6O14756 317 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 MPPED1O15442 326 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 CYB5BO43169 146 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 TFF1P04155 84 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 C1QTNF9P0C862 333 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 PET100P0DJ07 73 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 S100A10P60903 97 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 SSX8Q7RTT4 187 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 NUP37Q8NFH4 326 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 PRR7Q8TB68 274 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ZZEF1O43149 2961 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 SMCO3A2RU48 225 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF222A6NCQ9 220 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 SRRM5B3KS81 715 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 IFNL4K9M1U5 179 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 THBDP07204 575 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ROS1P08922 2347 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 EGR1P18146 543 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 COL10A1Q03692 680 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 BSPH1Q075Z2 132 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB32Q13637 225 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 SPRNQ5BIV9 151 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM219AQ8IW50 185 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 LGI3Q8N145 548 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 UBALD1Q8TB05 177 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 TP53RKQ96S44 253 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 WIPI2Q9Y4P8 454 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 DPRXA6NFQ7 191 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 H0YIZ8 118 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 CRYGCP07315 174 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 GABRA2P47869 451 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 RND3P61587 244 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 SRPXP78539 464 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 AESQ08117 197 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 HMGN3Q15651 99 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 LRTM2Q8N967 370 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF126Q9BV68 326 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 METRNQ9UJH8 293 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 NBASA2RRP1 2371 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 TNFSF12O43508 249 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRTM4-202ENST00000409093 BCL2L11O43521 198 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms