RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395705.3

CTBP2-204, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 580 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-204	ENST00000395705	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705		A0A0A6YYH2	397 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705		A6NJ64	397 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	RBBP9	O75884	186 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	IGLV2-14	P01704	120 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	IGLV2-23	P01705	113 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	IGHG4	P01861	327 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	APOA2	P02652	100 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	PF4	P02776	101 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	IGLL1	P15814	213 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	VDAC1	P21796	283 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	BVES	Q8NE79	360 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	DDB2	Q92466	427 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	XRCC3	O43542	346 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	HLA-DQB1	P01920	261 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	PSMB8	P28062	276 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	CX3CL1	P78423	397 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	FOXE3	Q13461	319 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	PLGLA	Q15195	96 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	CTF1	Q16619	201 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	KLK15	Q9H2R5	256 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF580	Q9UK33	172 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC25A17	O43808	307 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	SOX15	O60248	233 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM127	O75204	238 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	TUSC2	O75896	110 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	CA2	P00918	260 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	CD33	P20138	364 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	ALDH3B2	P48448	385 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	THBS3	P49746	956 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	TAS2R20	P59543	309 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	ECSCR	Q19T08	205 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	GPR107	Q5VW38	600 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	RNF5	Q99942	180 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	GABARAP	O95166	117 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	IGLV1-40	P01703	118 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	CRYGB	P07316	175 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	ELANE	P08246	267 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTBP2-204	ENST00000395705	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTBP2-204	ENST00000395705	AADAC	P22760	399 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTBP2-204	ENST00000395705	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CTBP2-204	ENST00000395705	ARPC4	P59998	168 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM177	Q53S58	311 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTBP2-204	ENST00000395705	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CTBP2-204	ENST00000395705	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTBP2-204	ENST00000395705	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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