RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 RRN3P1Q2M238 152 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRK-207ENST00000368226 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
PTPRK-207ENST00000368226 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRK-207ENST00000368226 C7orf77A4D0Y5 90 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRK-207ENST00000368226 OR4C46A6NHA9 309 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRK-207ENST00000368226 H0YL77 283 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRK-207ENST00000368226 DEDDO75618 318 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRK-207ENST00000368226 MC5RP33032 325 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRK-207ENST00000368226 C1orf174Q8IYL3 243 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRK-207ENST00000368226 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
PTPRK-207ENST00000368226 CHAC2Q8WUX2 184 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRK-207ENST00000368226 TNFSF18Q9UNG2 199 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 NDUFB4O95168 129 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 ISG15P05161 165 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 CECR9P0C854 216 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 PPOXP50336 477 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 PTX4Q96A99 478 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM183BQ1AE95 376 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 Q6ZT83 130 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 A0A1W2PRX2 142 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 TFF1P04155 84 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 P2RY4P51582 365 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 DHRS11Q6UWP2 260 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 TRAV20A0A0B4J274 112 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 ADAM11O75078 769 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 AICDAQ9GZX7 198 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 CEP290O15078 2479 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM189A5PLL7 270 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 CEACAM1P13688 526 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 VAX1Q5SQQ9 334 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 DPPA3Q6W0C5 159 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 AQP3Q92482 292 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 POM121Q96HA1 1249 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 PGPA6NDG6 321 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 MARCH11A6NNE9 402 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 MOSP00540 346 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 CLDN18P56856 261 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 DUX5Q96PT3 197 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 UMODP07911 640 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 PLAURQ03405 335 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 PKIBQ9C010 78 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 PTPRFP10586 1907 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 BTF3P20290 206 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 ATP5G2Q06055 141 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 LINC01590Q5TEZ4 76 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 PCSK4Q6UW60 755 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 C1QL2Q7Z5L3 287 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 FAM216BQ8N7L0 139 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 OR5P3Q8WZ94 311 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 CLEC7AQ9BXN2 247 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 TET1Q8NFU7 2136 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 FXYD3Q14802 87 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 SH3BGRL3Q9H299 93 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 MMD2Q8IY49 270 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 PF4P02776 101 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 LIPFP07098 398 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 ELOBQ15370 118 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 CALHM1Q8IU99 346 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 Q96M66 194 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 GPR132Q9UNW8 380 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 C5orf52A6NGY3 159 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 C19orf35Q6ZS72 473 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 C9orf106Q8NAJ2 232 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 SEC16AO15027 2179 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 B9A039 149 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 IGHV1-2P23083 117 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF273Q14593 569 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 MEGF10Q96KG7 1140 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 TBX15Q96SF7 602 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-207ENST00000368226 IL19Q9UHD0 177 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms