RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR54Q9H977 334 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 EMC3Q9P0I2 261 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRO2289Q9P1D8 64 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM215AQ9Y5M1 114 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 GMEB1Q9Y692 573 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLCH2O75038 1416 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 GBF1Q92538 1859 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 DSCAMO60469 2012 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAV41A0A0B4J266 112 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 M0R381 172 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP8B1O43520 1251 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 MT-CO2P00403 227 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 UCHL1P09936 223 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF728P0DKX0 622 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXCL2P19875 107 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD24P25063 80 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAP1GDS1P52306 607 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM33P57088 247 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 SKP1P63208 163 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTN3A2P78410 334 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERHP84090 104 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXC5Q00444 222 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 FABP5Q01469 135 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF90Q03938 601 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPRXLQ17RH7 258 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q6ZTI0 123 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 LHFPL1Q86WI0 220 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 FUNDC1Q8IVP5 155 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD302Q8IX05 232 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 BAP18Q8IXM2 172 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC34Q8IZ02 419 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS4Y2Q8TD47 263 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 MS4A6AQ9H2W1 248 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFAP45Q9UL16 551 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCKAP5O14513 1909 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 COL4A2P08572 1712 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 C5orf49A4QMS7 147 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 TXNDC9O14530 226 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 HPGDSO60760 199 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 UGT2B7P16662 529 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXCL3P19876 107 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMB6P28072 239 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFNGR2P38484 337 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM11P57052 281 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2G2P60604 165 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 RELAQ04206 551 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 EBPQ15125 230 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA12Q7Z6I5 190 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC35E3Q7Z769 313 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 PACRGLQ8N7B6 248 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLDND2Q8NHS1 167 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC37A2Q8TED4 501 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMCR5Q8TEV8 140 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJB3Q8WWF6 145 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 SFRP2Q96HF1 295 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM109Q9BVC6 243 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 TIMM21Q9BVV7 248 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 TIPINQ9BVW5 301 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM222Q9H0R3 208 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 HES4Q9HCC6 221 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAAR3PQ9P1P4 343 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBN3Q75N90 2809 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAD50Q92878 1312 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1B0GVG6 124 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR6C6A6NF89 314 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFPL4AA6NLU0 287 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPYP01303 97 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 HLA-DQB2P05538 268 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 CASQ1P31415 396 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCR2P41597 374 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 GABRA2P47869 451 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL14P50914 215 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDPK2PQ6A1A2 396 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR13C8Q8NGS7 320 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASB13Q8WXK3 278 aa0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms