RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 STK38LQ9Y2H1 464 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 ROS1P08922 2347 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHD5Q8TDI0 1954 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAP3K19Q56UN5 1328 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 NDUFB2O95178 105 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 UCHL1P09936 223 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDK9P50750 372 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBM11P57052 281 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 SYCP1Q15431 976 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 NNATQ16517 81 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 LGALS9BQ3B8N2 356 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM155Q4W5P6 130 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 PACRGLQ8N7B6 248 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR51T1Q8NGJ9 327 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMIM12Q96EX1 92 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM208Q9BTX3 173 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 C8orf4Q9NR00 106 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTPRBP23467 1997 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 DLG5Q8TDM6 1919 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM94Q12767 1356 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TENM3Q9P273 2699 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 MYH11P35749 1972 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 M0R381 172 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 COPEO14579 308 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPYP01303 97 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCR2P41597 374 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRATP43155 626 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTBP2P56545 445 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 H2BFSP57053 126 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTAG1AP78358 180 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 AADACL4Q5VUY2 407 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM42Q69YG0 159 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 BAP18Q8IXM2 172 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC34Q8IZ02 419 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 BLIDQ8IZY5 108 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TLCD1Q96CP7 247 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 SFRP2Q96HF1 295 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBN2P35556 2912 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 REREQ9P2R6 1566 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRIN2BQ13224 1484 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 GOLGA8RI6L899 631 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TXNDC9O14530 226 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADAP1O75689 374 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP5G1P05496 136 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 CFL1P23528 166 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRPRP30550 384 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 KDELR2P33947 212 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 IFNGR2P38484 337 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 GABRA2P47869 451 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNAP25P60880 206 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 GNA12Q03113 381 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 C4orf26Q17RF5 130 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC36A2Q495M3 483 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 C17orf78Q8N4C9 275 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR52E4Q8NGH9 312 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR1L8Q8NGR8 309 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 STOML3Q8TAV4 291 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q8WTZ3 238 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPCDCQ96CD2 204 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 NMNAT3Q96T66 252 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTTY13Q9BZ97 58 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 NRBP2Q9NSY0 501 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 PARVAQ9NVD7 372 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 EMC3Q9P0I2 261 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TAAR3PQ9P1P4 343 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 BRWD1Q9NSI6 2320 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDH15Q96QU1 1955 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A087WUU8 490 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 METTL15A6NJ78 407 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 MKRN2OSH3BPM6 223 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLA2G10O15496 165 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLRC4O43908 158 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 CIAO1O76071 339 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TPM1P09493 284 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 RD3LP0DJH9 198 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 AKR1C3P42330 323 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 ETV1P50549 477 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM33P57088 247 aa0.47□□□□□ -2.33
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