RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 AK3Q9UIJ7 227 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MSGN1A6NI15 193 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 J3KRW8 73 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HPGDSO60760 199 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V1G1O75348 118 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 VENTXO95231 258 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MT-CO2P00403 227 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 REG1AP05451 166 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CD1AP06126 327 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MELTFP08582 738 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 AKAIN1P0CW23 69 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CEBPGP53567 150 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 AWAT1Q58HT5 328 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HEPN1Q6WQI6 88 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ARPC1AQ92747 370 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GAFA1Q96PS6 74 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FBXL7Q9UJT9 491 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GW55 424 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 C12orf77C9JDV5 145 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PIN1P1O15428 100 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MED6O75586 246 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ARL16Q0P5N6 197 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SPANXN5Q5MJ07 72 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CNIH2Q6PI25 160 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 LAX1Q8IWV1 398 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR11H1Q8NG94 326 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR8H1Q8NGG4 311 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR1N2Q8NGR9 330 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IGFBPL1Q8WX77 278 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DUX4Q9UBX2 424 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0G2JK05 382 aa3.64□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 GPR31O00270 319 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ST8SIA3O43173 380 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MT-ND4P03905 459 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SCTP09683 121 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TNFSF8P32971 234 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HILS1P60008 231 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 BLCAPP62952 87 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 LIAT1Q6ZQX7 453 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZRG5 221 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00596Q86U02 117 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC190Q86UF4 302 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 STX12Q86Y82 276 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CD177Q8N6Q3 437 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM104Q8NE00 496 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 JPT1Q9UK76 154 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PS18 150 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf63A6NC05 138 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OOSP1A8MZH6 123 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 H0Y980 276 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CD55P08174 381 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TBPP20226 339 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GIFP27352 417 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ETV6P41212 452 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 KIR2DS2P43631 304 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR2B8PP59922 312 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RPL8P62917 257 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SP6Q3SY56 376 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 EBLN2Q6P2I7 272 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS45Q7RTY3 260 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 LGI3Q8N145 548 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N402 240 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 Q8NFD4 153 aa3.63□□□□□ -1.83
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