RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 GNB3P16520 340 aa11.77□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 PSMD7P51665 324 aa11.77□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 RPS16P62249 146 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 PJVKQ0ZLH3 352 aa11.77□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 PLGLAQ15195 96 aa11.77□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 ZNF367Q7RTV3 350 aa11.77□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa11.77□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 OR10R2Q8NGX6 335 aa11.77□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 MAFIPQ8WZ33 124 aa11.77□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 RHOVQ96L33 236 aa11.77□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 NDUFB11Q9NX14 153 aa11.77□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 ZNF221Q9UK13 617 aa11.77□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.76□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.76□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa11.76□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 SLC25A17O43808 307 aa11.76□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 INSL3P51460 131 aa11.76□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 ACTBL2Q562R1 376 aa11.76□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa11.76□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 PDPNQ86YL7 162 aa11.76□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 MS4A10Q96PG2 267 aa11.76□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 SDHAF2Q9NX18 166 aa11.76□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 LINC01619G3V211 115 aa11.75□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 SPDEFO95238 335 aa11.75□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 IGHV3-11P01762 117 aa11.75□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 SERPINB10P48595 397 aa11.75□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 C22orf42Q6IC83 251 aa11.75□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.75□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 SLC35D1Q9NTN3 355 aa11.75□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 GALP22466 123 aa11.74□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 FXYD3Q14802 87 aa11.74□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 ZNF429Q86V71 674 aa11.74□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.74□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 TNCP24821 2201 aa11.74□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 SPNP16150 400 aa11.73□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 OR10J5Q8NHC4 309 aa11.73□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 GRPEL2Q8TAA5 225 aa11.73□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 DDB2Q92466 427 aa11.73□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 RAB26Q9ULW5 256 aa11.73□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 A0A075B6Q4 140 aa11.72□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 MYL9P24844 172 aa11.72□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 LGALS7P47929 136 aa11.72□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 TMEM177Q53S58 311 aa11.72□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 SPARTQ8N0X7 666 aa11.72□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 BVESQ8NE79 360 aa11.72□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 BLOC1S6Q9UL45 172 aa11.72□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 LINC00473A8K010 186 aa11.71□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
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CTSW-201ENST00000307886 GADD45AP24522 165 aa11.71□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 GABARAPL2P60520 117 aa11.71□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 CDNFQ49AH0 187 aa11.71□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.71□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 SLA2Q9H6Q3 261 aa11.71□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CTSW-201ENST00000307886 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CTSW-201ENST00000307886 LY86O95711 162 aa11.7□□□□□ -0.54
CTSW-201ENST00000307886 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CTSW-201ENST00000307886 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
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