RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2QL1A1L167 161 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF320A2RRD8 509 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ERICH4A6NGS2 130 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MSGN1A6NI15 193 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 BMPR1BO00238 502 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 PDCD6O75340 191 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 DHFRP00374 187 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV12-3P01733 135 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MYOD1P15172 320 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 CALB2P22676 271 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB25P24278 435 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 TPBGQ13641 420 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL39P5Q59GN2 51 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 AWAT2Q6E213 333 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 GPHB5Q86YW7 130 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2C3Q8N628 320 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 GVQW1Q8N7I0 195 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM46BQ96A09 425 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT14Q96FL9 552 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 NEDD4LQ96PU5 975 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SPIN2AQ99865 258 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SELENOIQ9C0D9 397 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ORC6Q9Y5N6 252 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLL5B9A064 214 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BNX3 289 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 DYNC1I1O14576 645 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SHOXO15266 292 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 RRASP10301 218 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 HMGN3Q15651 99 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 RTL8BQ17RB0 113 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC58Q4VC31 144 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 KDM4DQ6B0I6 523 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH26Q8IXH8 852 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 JAGN1Q8N5M9 183 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 HARBI1Q96MB7 349 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 RARRES2Q99969 163 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 THTPAQ9BU02 230 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MED4Q9NPJ6 270 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF581Q9P0T4 197 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 GHRLQ9UBU3 117 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC4Q99102 2169 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 DPPA5A6NC42 116 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4C46A6NHA9 309 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MGMTP16455 207 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ADMP35318 185 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 TNXAQ16473 311 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 C15orf32Q32M92 178 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 OR13C5Q8NGS8 318 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SETD6Q8TBK2 473 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 Q96MT0 163 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 KMT2AQ03164 3969 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PP11 408 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MPTX1A8MV57 137 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 A8MWP6 167 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2C1O95371 312 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 BAG2O95816 211 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1-16P04430 117 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 P0DMU3 169 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM231AP0DMU4 169 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM231CP0DMU5 169 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 FCGR1AP12314 374 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 GALP22466 123 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL3P36405 182 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 CEACAM6P40199 344 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MFAP2P55001 183 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
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