RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 CXCL2P19875 107 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM140Q9NV12 185 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.74□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 C3AR1Q16581 482 aa7.74□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 VPS25Q9BRG1 176 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 C4orf51C9J302 202 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 KBTBD11O94819 623 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 IL11P20809 199 aa7.74□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.73□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 RD3LP0DJH9 198 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 EGR4Q05215 589 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.72□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 LINC00869P0C866 280 aa7.72□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.72□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.72□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 PAX1P15863 534 aa7.72□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 PRR7Q8TB68 274 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 TIMP4Q99727 224 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 SCTP09683 121 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 MSL2Q9HCI7 577 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 MARCH11A6NNE9 402 aa7.71□□□□□ -1.17
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