RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 BRWD1Q9NSI6 2320 aa13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 CRXO43186 299 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 FGF12P61328 243 aa13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 DTX4Q9Y2E6 619 aa13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 TAF1P21675 1872 aa13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 CXCL1P09341 107 aa13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 WDR54Q9H977 334 aa13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 CEACAM1P13688 526 aa13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 GCHFRP30047 84 aa13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 ZNF735P0CB33 412 aa13.83□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 ADMP35318 185 aa13.83□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PPE3 182 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 PPIAL4DF5H284 164 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 HARBI1Q96MB7 349 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 ELOVL5Q9NYP7 299 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 C3orf80F5H4A9 247 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 C8orf88P0DMB2 117 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 SRD5A2P31213 254 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 GFRALQ6UXV0 394 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 G6PC2Q9NQR9 355 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A10PA6NDY2 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A18PA6NE21 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A16PA6NEW6 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A7PA6NKC0 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A22PA8MWA6 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A12PA8MX19 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A15PP0C7V4 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A13PP0C7W8 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A14PP0C7W9 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A24PP0C7X0 464 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 ZG16O60844 167 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 RPL31P62899 125 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 C1orf210Q8IVY1 113 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 TMEM52Q8NDY8 209 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 GRAMD2BQ96HH9 432 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 RTN4RQ9BZR6 473 aa13.83□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 NGFRP08138 427 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 OR4A8P0C604 315 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 PPP1CAP62136 330 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 Q96M66 194 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 ARAP2Q8WZ64 1704 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 CA7P43166 264 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 WFDC8Q8IUA0 241 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 ZNF645Q8N7E2 425 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 LOXL2Q9Y4K0 774 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 SELENOTP62341 195 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 HILPDAQ9Y5L2 63 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 LMO7DNF2Z398 122 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 CRYBA2P53672 197 aa13.82□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 KNL1Q8NG31 2342 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 CISD3P0C7P0 127 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 TM4SF20Q53R12 229 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 OR4D5Q8NGN0 318 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 TNFSF14O43557 240 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 TM4SF19Q96DZ7 209 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 ZNF488Q96MN9 340 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 SCN4AP35499 1836 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 CEACAM18A8MTB9 384 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP13.81□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 24.1
CTIF-201ENST00000256413 TCF23Q7RTU1 214 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 LHX9Q9NQ69 397 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 H0YIZ8 118 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 TCF24Q7RTU0 167 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 DEFB124Q8NES8 71 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 GFRA3O60609 400 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 POU2F2P09086 479 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 KLRB1Q12918 225 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 TEX29Q8N6K0 151 aa13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 KLF4O43474 513 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 SSTR5P35346 364 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 KRTCAP3Q53RY4 240 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 C2orf83Q53S99 150 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 GPBAR1Q8TDU6 330 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-201ENST00000256413 TMEM242Q9NWH2 141 aa13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms