RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AccslQ3UX83 580 aa8.67□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr5Q60889 312 aa8.67□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxo27Q6DIA9 280 aa8.67□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr112Q8C0S2 320 aa8.67□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spred2Q924S7 410 aa8.67□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tomm40lQ9CZR3 308 aa8.67□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnase6Q9D244 153 aa8.67□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem170aQ9D342 144 aa8.67□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aig1Q9D8B1 262 aa8.67□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm28729A0A1B0GSW2 409 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arxes1C0HK79 180 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arxes2C0HK80 180 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P06335 190 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hsf1P38532 525 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Oprm1P42866 398 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wfdc5Q4KXB6 126 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SargQ8BI29 606 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scgb1b27Q91WB5 92 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Unc13cQ8K0T7 2210 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fcgr4A0A0B4J1G0 249 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr555E9Q547 315 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10638F6QEG2 257 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P06321 130 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prkar2aP12367 401 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dcaf7P61963 342 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr324Q5NCC7 333 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tnfsf15Q5UBV8 252 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8C3I9 435 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tex46Q9CPU3 165 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sgms2Q9D4B1 365 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P2rx4Q9JJX6 388 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NgfrQ9Z0W1 417 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fer1l5P0DM40 2038 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr715bE9Q725 315 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm20834J3QM72 227 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wnt1P04426 370 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hist1h1aP43275 213 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Apobec4Q497M3 374 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Jagn1Q5XKN4 183 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ovch2Q7M761 609 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tbl1xr1Q8BHJ5 514 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Crispld2Q8BZQ2 495 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Depp1Q8K2F3 205 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Syngr3Q8R191 229 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sectm1aQ921W8 192 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Xrcc3Q9CXE6 349 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tstd3Q9D0B5 157 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q9D4G1 230 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppp1r35Q9D8C8 260 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndufb10Q9DCS9 176 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prss21Q9JHJ7 324 aa8.66□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm12790B1AUV6 201 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hbb-yP02104 147 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc2a1P17809 492 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chrna7P49582 502 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nr2c2apQ3TV70 140 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mbd6Q3TY92 1003 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr183Q3U6B2 357 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prss44Q402U7 372 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr524Q7TRU0 318 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr361Q8VF16 322 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdc42ep3Q9CQC5 254 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Foxj2Q9ES18 565 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Myo7aP97479 2215 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 H2al1jA2BFR3 109 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4931429L15RikE9PVU2 379 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr739E9Q1P0 309 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr773F6VS78 311 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm21834J3QN05 151 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Raet1bO08603 253 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rab11aP62492 216 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmprss9P69525 1065 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AbraclQ4KML4 81 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr782Q7TRI2 314 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GgnQ80WJ1 673 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Degs2Q8R2F2 323 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 D1Ertd622eQ8VEB3 207 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1009Q8VFK1 314 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr772Q8VGC5 311 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ctag2Q9D9S4 219 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcnk5Q9JK62 502 aa8.65□□□□□ -1.02
Nedd1-201ENSMUST00000020163 BC025446A0A087WQT1 134 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv8-2A0A0A6YW58 119 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv1-47A0A0A6YY41 117 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ear14F6YUX7 155 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r170K7N6W9 304 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnase2O35291 155 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Itgb2P11835 771 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Upk2P38575 184 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FmodP50608 376 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Isoc2aP85094 206 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Akt2Q60823 481 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rasl2-9Q61820 216 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sf3a2Q62203 475 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr923Q7TRB9 317 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Upk3bQ80YF6 275 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dppa1Q810Y7 116 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CyrenQ8BHZ5 157 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smco3Q8BQM7 225 aa8.64□□□□□ -1.03
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1408Q8VG32 310 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.4 ms