RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL39P5Q59GN2 51 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM268Q5VZI3 342 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 GGNBP1Q5YKI7 109 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF695Q8IW36 515 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 LYG1Q8N1E2 194 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35G3Q8N808 338 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 IL22RA2Q969J5 263 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC22AQ96IW7 307 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 PDCD10Q9BUL8 212 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 ONECUT1Q9UBC0 465 aa20.35■□□□□ 0.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PPE2 198 aa20.34■□□□□ 0.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 Q8N7P7 452 aa20.34■□□□□ 0.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD12Q8N2K0 398 aa20.33■□□□□ 0.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 ARID1AO14497 2285 aa20.33■□□□□ 0.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa20.32■□□□□ 0.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa20.32■□□□□ 0.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV1D-39P04432 117 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 DNASE1P24855 282 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 ARF6P62330 175 aa20.32■□□□□ 0.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf50Q96LR7 162 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa20.31■□□□□ 0.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFRSF14Q92956 283 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 S1PR3Q99500 378 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXH1O75593 365 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 RPA2P15927 270 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 DLX1P56177 255 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 IL15RAQ13261 267 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC12BQ2HXU8 276 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB113Q30KQ7 82 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 SPAG16Q8N0X2 631 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 OR11H4Q8NGC9 324 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 HYLS1Q96M11 299 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 RAMP3O60896 148 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 VDAC1P21796 283 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 LPAR6P43657 344 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10X1Q8NGY0 326 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 DDB2Q92466 427 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC7AQ9BXN2 247 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 CENPEQ02224 2701 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM157AC9JC47 383 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV1-47P01700 117 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF137PP52743 207 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 NMSQ5H8A3 153 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2B11Q5JQS5 317 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 KPTNQ9Y664 436 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 TOR1AO14656 332 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A16P16260 332 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 PRTN3P24158 256 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 THBS3P49746 956 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 PRRX1P54821 245 aa20.27■□□□□ 0.84
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