RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 ARG2P78540 354 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SERF2P84101 59 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 WDR31Q8NA23 367 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SDF2L1Q9HCN8 221 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV2-70P01814 119 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TRGC2P03986 189 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SSTR5P35346 364 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 RND2P52198 227 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 RPS16P62249 146 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF610Q8N9Z0 462 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TCEAL7Q9BRU2 100 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 OR51M1Q9H341 326 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 FZR1Q9UM11 496 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00473A8K010 186 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CLDN1O95832 211 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 S100A9P06702 114 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TNFSF10P50591 281 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TFF3Q07654 80 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 GGACTQ9BVM4 153 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TOLLIPQ9H0E2 274 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM210A6NLX4 147 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 DEFA4P12838 97 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFA6P56556 154 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 PYY3Q5JQD4 70 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 VWA1Q6PCB0 445 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 WDR82Q6UXN9 313 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ACP7Q6ZNF0 438 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 MRGPRDQ8TDS7 321 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC30A6NM36 301 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ZG16O60844 167 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV3-15P01624 115 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SOD3P08294 240 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SLC35E4Q6ICL7 350 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 FAM180AQ6UWF9 173 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 OR13A1Q8NGR1 328 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 GALMQ96C23 342 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 OBP2BQ9NPH6 170 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3-43DP0DP04 118 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SPINK9Q5DT21 86 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZT83 130 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TRIB1Q96RU8 372 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 DCTN5Q9BTE1 182 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 VAX2Q9UIW0 290 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 B4DEV8 164 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SOX8P57073 446 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 FAM214BQ7L5A3 538 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 MRGPRGQ86SM5 289 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 Q8N7P7 452 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 FRZBQ92765 325 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A22Q9H936 323 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 OOEPA6NGQ2 149 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 COX5AP20674 150 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 P2RX4Q99571 388 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CACNA1GO43497 2377 aa11.15□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 OR5H1A6NKK0 313 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 RNF212BA8MTL3 300 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 IGHG3P01860 377 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 MDKP21741 143 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 C9orf106Q8NAJ2 232 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 MSL2Q9HCI7 577 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM242Q9NWH2 141 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 PROP1O75360 226 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF737O75373 536 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 FOXF2Q12947 444 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 CD177Q8N6Q3 437 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 AGMATQ9BSE5 352 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 UFSP2Q9NUQ7 469 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 KCNIP1Q9NZI2 227 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB108AA8MXU0 73 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 M0R296 226 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 TRGC1P0CF51 173 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 COL10A1Q03692 680 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 PMS2P11Q13670 270 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 ZBTB34Q8NCN2 500 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms