RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 TNFSF4P23510 183 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 NPPCP23582 126 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 COL8A2P25067 703 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 TGFBR3Q03167 851 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf174Q8IYL3 243 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 FAM89BQ8N5H3 189 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM234Q8WY98 164 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 KLRF1Q9NZS2 232 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 ABCA4P78363 2273 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PPC4 97 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 IFNA1P01562 189 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV3-11P04433 115 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 RAC2P15153 192 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 TSPOP30536 169 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 PSG4Q00888 419 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 Q8N976 141 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 OR4B1Q8NGF8 309 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 FBLN5Q9UBX5 448 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PRS3 328 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 HSPB6O14558 160 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 NAPSAO96009 420 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 CTRLP40313 264 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 IER3P46695 156 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 CFHR1Q03591 330 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 SIRPB1O00241 398 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 TSPAN2O60636 221 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 PSMB3P49720 205 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 LHX2P50458 406 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 CLRN1P58418 232 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 PRR27Q6MZM9 219 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 OR51H1Q8NH63 302 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 OR1L3Q8NH93 324 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 RCHY1Q96PM5 261 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 NRN1Q9NPD7 142 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 SPG11Q96JI7 2443 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0U1RQV5 110 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 MS4A18H0YCH9 400 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 GLB1P16278 677 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 CD38P28907 300 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 CORO2AQ92828 525 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 SARAFQ96BY9 339 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PNR3 127 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFB4O95168 129 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 TYMSP04818 313 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 FASLGP48023 281 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 BAXQ07812 192 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 IGFBP7Q16270 282 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZPA2 131 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 GAPTQ8N292 157 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 OR4C12Q96R67 309 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 P2RX4Q99571 388 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 FCN1O00602 326 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 PPYP01298 95 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 ATP5G3P48201 142 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 CCR5P51681 352 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 PAFAH1B2P68402 229 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF90Q03938 601 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 ZP4Q12836 540 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-211ENST00000618610 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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