RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	COMMD2	Q86X83	199 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	UBALD1	Q8TB05	177 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	NDNF	Q8TB73	568 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	CYGB	Q8WWM9	190 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	STMN2	Q93045	179 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RDH12	Q96NR8	316 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	SPACA5	Q96QH8	159 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	MICU1	Q9BPX6	476 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	CHST5	Q9GZS9	411 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1W2PPI3	338 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ERICH4	A6NGS2	130 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	MSGN1	A6NI15	193 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR5B21	A6NL26	309 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR2AT4	A6NND4	320 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	LGALS9	O00182	355 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	SYT7	O43581	403 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF737	O75373	536 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	TPPP	O94811	219 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ISG15	P05161	165 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	CALCB	P10092	127 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	CTRB1	P17538	263 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	CAPG	P40121	348 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	HAAO	P46952	286 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	NPBWR2	P48146	333 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	CCR9	P51686	369 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	AQP4	P55087	323 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	DLX6	P56179	175 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ACTC1	P68032	377 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ACTA1	P68133	377 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RAB40B	Q12829	278 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	MICB	Q29980	383 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	UTF1	Q5T230	341 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	SYS1	Q8N2H4	156 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR52I2	Q8NH67	350 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	GGH	Q92820	318 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ITFG2	Q969R8	447 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM106A	Q96A25	262 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	SLAMF9	Q96A28	289 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RFT1	Q96AA3	541 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	FGGY	Q96C11	551 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	SDSL	Q96GA7	329 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	STUB1	Q9UNE7	303 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768		A0A087WW49	117 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	MPZL2	O60487	215 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	PAGE4	O60829	102 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	HTR1A	P08908	422 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	CD7	P09564	240 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	ATF1	P18846	271 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	BCL3	P20749	454 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	GLRA1	P23415	457 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	ATP6V1E1	P36543	226 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	CAV3	P56539	151 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	ACTA2	P62736	377 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	ACTG2	P63267	376 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	MZT1	Q08AG7	82 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MLH1-223	ENST00000616768	IL24	Q13007	206 aa		3.52	□□□□□ -1.85

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